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基于CT扫描技术量化土壤孔隙与作物根系空间关系的方法 

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申请/专利权人:江西农业大学

摘要:本发明公开了基于CT扫描技术量化土壤孔隙与作物根系空间关系的方法,包括对样品进行CT扫描和重建;对CT图像进行前处理;通过Threshold工具获得土壤孔隙的二值图像;运用Tubeness工具提取作物根系,获得作物根系的二值图像;使用MergeChannels工具对土壤孔隙和作物根系的图像进行不同颜色的合并;根据3DViewer工具实现根‑孔空间关系的三维可视化;利用ImageCalculator工具的Min运算符获得土壤孔隙和作物根系相交的图像。本发明通过CT扫描技术可以无损地观测土壤孔隙结构与作物根系之间的相互作用,对根‑孔空间关系进行三维量化,明确作物根系进入土壤孔隙的体积、表面积、直径、长度、弯曲度和角度等特征参数,为适合作物根系生长的良好孔隙结构特征的研究提供技术支撑。

主权项:1.基于CT扫描技术量化土壤孔隙与作物根系空间关系的方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤S1:选取包含有植物根系的土壤样品,对样品进行CT扫描,重建后获取TIFF格式的CT图像;步骤S2:运用ImageJ软件对步骤S1的CT图像进行亮度、对比度调整、滤波和裁剪前处理;步骤S3:对步骤S2的图像,通过ImageJ软件中的Threshold工具选取土壤孔隙的阈值,获得土壤孔隙的二值图像;步骤S4:对步骤S2的图像,通过ImageJ软件中Tubeness工具提取作物根系,获得作物根系的二值图像;步骤S5:通过ImageJ软件中的MergeChannels工具对步骤S3土壤孔隙和步骤S4作物根系的图像进行不同颜色的合并;步骤S6:运用ImageJ软件中3DViewer工具实现根-孔空间关系的三维可视化;步骤S7:通过ImageJ软件中ImageCalculator工具的Min运算符获得土壤孔隙和作物根系相交的图像,根据这个图像计算二者相交的特征参数。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 江西农业大学 基于CT扫描技术量化土壤孔隙与作物根系空间关系的方法

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