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申请/专利权人：北京市农林科学院

摘要：本发明涉及一种快速检测辣椒多个功能位点基因型的引物组合及其应用。多个功能位点选自细胞核雄性不育位点msc‑1、细胞核雄性不育位点msc‑2、辣味位点Pun1、辣味位点Pun3，果形位点Fs3.1Fl3.2，育性恢复位点CaRf032，花序形状位点fa和成熟果实颜色位点ccs中的至少两种。引物组合序列参见序列1至序列24。本发明通过多重PCR结合二代测序技术，可以一次性完成对上百份材料的多个比如8个功能位点标记的基因型检测，方便快捷。

主权项：1.一种引物组合，包括用于同时检测多个功能位点的基因型的多组引物对，多个所述功能位点选自细胞核雄性不育位点msc-1、细胞核雄性不育位点msc-2、辣味调控位点Pun1、辣味调控位点Pun3，果形位点Fs3.1Fl3.2，育性恢复位点CaRf032，花序形状位点fa和成熟果实颜色位点ccs中的至少两种；用于检测细胞核雄性不育位点msc-1基因型的引物对为正向引物CaQJ21-F和反向引物CaQJ21-R，其中CaQJ21-F的核苷酸序列如序列表中序列1所示，CaQJ21-R的核苷酸序列如序列表中序列2所示；用于检测细胞核雄性不育位点msc-2基因型的引物对为正向引物CaQJ22-F和反向引物CaQJ22-R，其中CaQJ22-F的核苷酸序列如序列表中序列3所示，CaQJ22-R的核苷酸序列如序列表中序列4所示；用于检测辣味调控位点Pun1基因型的引物对为CaQJ38-left引物对和CaQJ38-right引物对，其中：CaQJ38-left引物对为正向引物CaQJ38-left-F和反向引物CaQJ38-left-R，其中CaQJ38-left-F的核苷酸序列如序列表中序列5所示，CaQJ38-left-R的核苷酸序列如序列表中序列6所示；CaQJ38-right引物对为正向引物CaQJ38-right-F和反向引物CaQJ38-right-R，其中CaQJ38-right-F的核苷酸序列如序列表中序列7所示，CaQJ38-right-R的核苷酸序列如序列表中序列8所示；用于检测辣味调控位点Pun3基因型的引物对为正向引物CaQJ39-F和反向引物CaQJ39-R，其中CaQJ39-F的核苷酸序列如序列表中序列9所示，CaQJ39-R的核苷酸序列如序列表中序列10所示；用于检测果形位点Fs3.1Fl3.2基因型的引物对为正向引物CaQJ61-F和反向引物CaQJ61-R，其中CaQJ61-F的核苷酸序列如序列表中序列11所示，CaQJ61-R的核苷酸序列如序列表中序列12所示；用于检测育性恢复位点CaRf032基因型的引物对包括第一引物对、第二引物对、第三引物对、第四引物对中的至少一种，其中：所述第一引物对为正向引物CaQJ30-1-F和反向引物CaQJ30-1-R，其中CaQJ30-1-F的核苷酸序列如序列表中序列13所示，CaQJ30-1-R的核苷酸序列如序列表中序列14所示；所述第二引物对为正向引物CaQJ30-2-F和反向引物CaQJ30-2-R，其中CaQJ30-2-F的核苷酸序列如序列表中序列15所示，CaQJ30-2-R的核苷酸序列如序列表中序列16所示；所述第三引物对为正向引物CaQJ30-3-F和反向引物CaQJ30-3-R，其中CaQJ30-3-F的核苷酸序列如序列表中序列17所示，CaQJ30-3-R的核苷酸序列如序列表中序列18所示；所述第四引物对为正向引物CaQJ30-4-F和反向引物CaQJ30-4-R，其中CaQJ30-4-F的核苷酸序列如序列表中序列19所示，CaQJ30-4-R的核苷酸序列如序列表中序列20所示；用于检测花序形状位点fa基因型的引物对为正向引物CaQJ31-1-F和反向引物CaQJ31-1-R，其中CaQJ31-1-F的核苷酸序列如序列表中序列21所示，CaQJ31-1-R的核苷酸序列如序列表中序列22所示；用于检测成熟果实颜色位点ccs基因型的引物对为正向引物CaQJ32-F和反向引物CaQJ32-R，其中CaQJ32-F的核苷酸序列如序列表中序列23所示，CaQJ32-R的核苷酸序列如序列表中序列24所示。

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