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一株无质粒、以葡萄糖等廉价碳源为底物从头高效合成胞苷的基因工程菌、方法和应用 

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申请/专利权人:天津科技大学

摘要:本发明公开一株无质粒、以葡萄糖等廉价碳源为底物从头高效合成胞苷的基因工程菌,所述胞苷基因工程菌是在尿苷基因工程菌E.coliUR11的基础上,缺失了胞苷脱氨酶Cdd;缺失了嘧啶单磷酸核苷酶YgdH;缺失了胞苷酸激酶CmK;缺失了核苷三磷酸焦磷酸水解酶YhdE和MazG;过表达内源的核苷三磷酸焦磷酸水解酶NudG;过表达枯草芽孢杆菌来源的携带突变点的尿苷酸激酶PyrHD90A;过表达枯草芽孢杆菌来源的携带突变点的胞苷三磷酸合酶PyrGE156K;缺失了核苷三磷酸还原酶NrdD。本发明工程菌解除了UMP和CTP对胞苷合成途径关键酶的反馈调节,增加了胞苷合成的代谢通量。

主权项:1.一株无质粒、以葡萄糖廉价碳源为底物从头高效合成胞苷的基因工程菌,其特征在于:所述胞苷基因工程菌是在尿苷基因工程菌E.coliUR11的基础上,缺失了胞苷脱氨酶Cdd;缺失了嘧啶单磷酸核苷酶YgdH;缺失了胞苷酸激酶CmK;缺失了核苷三磷酸焦磷酸水解酶YhdE和MazG;过表达内源的核苷三磷酸焦磷酸水解酶NudG;过表达枯草芽孢杆菌来源的携带突变点的尿苷酸激酶PyrHD90A;过表达枯草芽孢杆菌来源的携带突变点的胞苷三磷酸合酶PyrGE156K;缺失了核苷三磷酸还原酶NrdD;其中,所述Cdd的基因序列为SEQIDNO.1,YgdH的基因序列为SEQIDNO.2,CmK的基因序列为SEQIDNO.3,YhdE的基因序列为SEQIDNO.4,MazG的基因序列为SEQIDNO.5,NudG的基因序列为SEQIDNO.6,PyrHD90A的基因序列为SEQIDNO.7,PyrGE156K的基因序列为SEQIDNO.9,NrdD的基因序列为SEQIDNO.11;所述尿苷基因工程菌E.coliUR11是在E.coliW3110的基因组上整合了来源于B.subtilisA260的嘧啶核苷操纵子PyrBCAKDFE,由强启动子Ptrc控制;敲除尿苷激酶基因udk、尿苷磷酸化酶基因udp和核苷水解酶基因rihA、rihB和rihC;在基因组上对其自身PRPP合成酶基因prsA进行双拷贝,由强启动子Ptrc启动;敲除高丝氨酸脱氢酶基因thrA;敲除鸟氨酸氨甲酰转移酶基因argF;如上所述的胞苷的基因工程菌的构建方法,所述方法是采用CRISPRCas9介导的基因编辑技术对E.coliUR11基因组进行定向改造;步骤如下:(1)敲除胞苷脱氨酶基因cdd,cdd基因序列为SEQIDNO.1;(2)敲除嘧啶单磷酸核苷酶基因ygdH,ygdH基因序列为SEQIDNO.2;(3)敲除胞苷酸激酶基因cmK,cmK基因序列为SEQIDNO.3;(3)敲除核苷三磷酸焦磷酸酶基因yhdE,yhdE基因序列为SEQIDNO.4;(4)敲除核苷三磷酸焦磷酸酶基因mazG,mazG基因序列为SEQIDNO.5;(5)在假基因位点yeeP、mbhA、yjiT分别整合大肠杆菌内源的核苷三磷酸焦磷酸水解酶基因nudG,nudG基因序列为SEQIDNO.6,由强启动子Ptrc控制;(6)在胞苷脱氨酶基因位点cdd和假基因位点yghE分别整合枯草芽孢杆菌来源的携带突变点的尿苷酸激酶基因pyrHD90A,cdd基因序列为SEQIDNO.1,pyrHD90A基因序列为SEQIDNO.7,由强启动子Ptrc控制,尿苷酸激酶氨基酸序列为SEQIDNO.8;(7)在胞苷酸激酶基因位点cmK、假基因位点ilvG分别整合枯草芽孢杆菌来源的携带突变点的胞苷三磷酸合酶基因pyrGE156K,cmK基因序列为SEQIDNO.3,pyrGE156K基因序列为SEQIDNO.9,由强启动子Ptrc控制,胞苷三磷酸合酶氨基酸序列为SEQIDNO.10;(8)敲除核苷三磷酸还原酶基因nrdD,nrdD基因序列为SEQIDNO.11;所述强启动子Ptrc的基因序列为SEQIDNO.12;所述Ptrc终止子的基因序列为SEQIDNO.13。

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