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一种自动化的深度学习增强DTI-ALPS的计算方法 

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申请/专利权人:深圳脑健生物技术有限公司

摘要:本发明公开一种自动化的深度学习增强DTI‑ALPS的计算方法。本发明应用于神经退行性疾病的早期诊断的辅助证据和病情监测,尤其是在阿尔茨海默病和帕金森病的研究中显示出巨大潜力。与现有技术相比,本发明能够在大规模人群中快速准确地评估脑部代谢废物清除功能,为临床实践提供了一种新的、非侵入性的生物标志物检测方法。此外,本技术还可用于探索与疾病严重程度、进展及其他生物标志物的相关性,为神经退行性疾病的治疗和研究开辟了新的途径。

主权项:1.一种自动化的深度学习增强DTI-ALPS的计算方法,其特征在于,包括以下步骤:S1:从数据库中获取若干MRI的DTI数据;S2:使用FSL软件进行DTI数据的预处理,步骤如下:将DTI数据从DICOM格式转换为与FSL兼容的NIFTI格式;使用FSL的eddy_correct和bet工具分别进行头部运动校正和脑部提取;应用FSL的dtifit工具将弥散张量模型拟合到包含所有弥散加权图像体积的nii文件,为每个体素产生张量参数;使用FSL的fslsplit工具将张量文件分割成多个3D文件,每个文件代表一个张量分量;所述nii文件,包含弥散张量模型的输出,使用PythonImagingLibrary转换成颜色编码的RGB图像,体素值代表主特征向量的方向;S3:训练CNN模型,将颜色编码的RGB图像分为两类;第一类图像对应于侧脑室体的水平,显示PVS和白质束以左右方向排列的图片;第二类图像为其他图片;对于第一类图像,使用labelimg图形图像注释工具进行进一步注释;在两个半球的深静脉周围PVS的ROIs被标记为“left”和“right”;ROIs被绘制为围绕PVS的矩形边界框;训练YOLOv5目标检测模型,对分类好的图像进行目标检测;S4:利用cv2Python库确定了YOLOv5检测到的ROI内蓝绿边界线的坐标,获取投射纤维和联合纤维之间的边界;使用fslmaths工具,勾画并二值化两个ROI作为投射纤维和联合纤维的掩模;投射纤维呈头足或前后方向,垂直于PVS,与沿左右方向、平行于PVS的联合纤维形成对比;S5:从ROI内提取参数,用来计算DTI参数,所述参数包括沿x轴、y轴和z轴的扩散率;S6:根据提取到的参数,通过DTI-ALPS指数计算公式计算出DTI-ALPS指数;所述DTI-ALPS指数计算公式为:ALPS=meanDxxproj,DxxassocmeanDyyproj,Dyyassoc其中Dxxproj和Dxxassoc分别为投射纤维ProjectionFiber和联合纤维AssociationFiber在X轴方向上的扩散率,Dyyproj和Dyyassoc分别为投射纤维和联合纤维在Y轴方向上的扩散率。

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