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一种检测突变位点的单碱基替换的引物及其在制备检测幽门螺杆菌耐药基因相关产品中的应用 

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申请/专利权人:深圳市海微生物科技有限公司

摘要:本发明公开了一种检测突变位点的单碱基替换的引物及其在制备检测幽门螺杆菌耐药基因相关产品中的应用。与现有技术中检测幽门螺杆菌耐药基因突变位点的常用方法相比,本发明不必针对每一个突变位点设计单独的一对引物探针组合,而是能够实现多个突变位点共用一对下游引物和探针,且10个突变位点只用一管反应即可全部检出,操作简便,经济高效。并且本发明的pool‑ARMS方法的最低检测限仅为1pgμL,特异性高,重复性好,结果准确可靠,极大提高了幽门螺旋杆菌耐药性的临床判定效率,具有广阔的应用前景。

主权项:1.一种检测突变位点的单碱基替换的引物组,其特征在于,所述引物组检测耐药基因的突变位点的单碱基替换;所述耐药基因包括幽门螺杆菌的23SrRNA基因和gyrA基因;所述引物组包含上游引物和下游引物;所述23SrRNA基因的突变位点包括A2142G、A2143G、A2143C和A2144G;A2142G的参考基因组为AB088058.1和AB088057.1;A2143G的参考基因组为AB088062.2、AB088059.1、AB088060.1、AB088064.1、AB088065.1和AB088061.1;A2143C的参考基因组为AB088051.1;A2144G的参考基因组为AB162858.1;检测所述23SrRNA基因的突变位点的所述上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.1~3所示;所述gyrA基因的突变位点包括A260T、C261A、C261G、G271A、C271A、G271T和A272G;A260T的参考基因组为LC425776.1;C261A的参考基因组为LC567331.1、LC567371.1和LC425777.1;C261G的参考基因组为LC425756.1、LC425776.1和LC425785.1;C271A的参考基因组为LC567329.1、LC567376.1和LC425760.1;G271A的参考基因组为LC425770.1;G271T的参考基因组为LC567137.1、LC567377.1和LC567140.1;A272G的参考基因组为LC567138.1、LC567372.1和LC567136.1;检测所述gyrA基因的突变位点的所述上游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.6~11所示;核苷酸序列如SEQIDNO.2、SEQIDNO.3、SEQIDNO.9~11所示的所述上游引物的3’端最后一个碱基设有锁核酸修饰;检测所述23SrRNA基因的突变位点的所述下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.4所示;检测所述gyrA基因的突变位点的所述下游引物的核苷酸序列如SEQIDNO.12所示。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 深圳市海微生物科技有限公司 一种检测突变位点的单碱基替换的引物及其在制备检测幽门螺杆菌耐药基因相关产品中的应用

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