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申请/专利权人：中南大学
摘要：本公开实施例中提供了一种靶点突变对药物靶点结合亲和力影响定量评估方法，属于生物信息学技术领域，具体包括：将药物SMILES作为输入，获取最终的药物的特征向量；将靶点的序列作为输入，使用多层一维卷积神经网络从靶点的序列中提取靶点的特征向量；使用非对称的交叉注意力机制获取药物和靶点对的融合特征向量；将融合特征向量输入初始模型预测药物和靶点的亲和力，计算损失，并基于反向传播方法更新初始模型的参数；直到模型拟合，得到预训练模型；使用突变数据集对预训练模型进行微调，得到目标模型；使用目标模型对特定的药物和靶点的亲和力进行预测，得到预测分值。通过本公开的方案，提高了预测效率和精准度。
主权项：1.一种靶点突变对药物靶点结合亲和力影响定量评估方法，其特征在于，包括：步骤1，将药物SMILES作为输入，通过RDKit工具包，将药物的原子作为节点，化学键作为边将药物SMILES转化为药物分子图，并且使用定向消息传递神经网络聚合药物分子图上节点信息，使用Readout函数获取最终的药物的特征向量；步骤2，将靶点的序列作为输入，使用TAPE分词技术对氨基酸序列划分不同的token，初始化每一个氨基酸的特征向量，然后使用多层一维卷积神经网络从靶点的序列中提取靶点的特征向量；步骤3，基于Transformer架构，使用非对称的交叉注意力机制融合药物的特征向量和靶点的特征向量，获取药物和靶点对的融合特征向量；步骤4，将融合特征向量输入初始模型预测药物和靶点的亲和力，使用MSE损失函数计算损失，并使用Adam优化器基于反向传播方法更新初始模型的参数；步骤5，重复步骤1至步骤4，直到模型拟合，得到预训练模型；步骤6，使用突变数据集对预训练模型进行微调，得到目标模型；步骤7，使用目标模型对特定的药物和靶点的亲和力进行预测，得到预测分值。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 中南大学 靶点突变对药物靶点结合亲和力影响定量评估方法
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