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针对低变异等位基因频率的基于超快分子倒置探针的靶向测序测定 

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申请/专利权人:耶达研究与开发有限公司

摘要:本文提供了一种改进的分子倒置探针方案,该方案表现出降低的噪声、高特异性和灵敏度以及在GC富集区处的改进的覆盖率。

主权项:1.一种基于分子倒置探针的靶向测序方法,所述方法包括以下步骤:a.使至少一种分子倒置探针MIP与至少一种靶核酸序列接触,并温育一小时至三个半小时的杂交时间,所述MIP包含:i第一区域,所述第一区域包含与所述靶核酸序列中的第一靶区域互补的第一序列,和ii第二区域,所述第二区域包含与所述靶核酸序列中的第二靶区域互补的第二序列;从而获得与所述靶核酸序列的所述第一靶区域和所述第二靶区域杂交的MIP;以及b.使步骤a中获得的杂交的MIP在反应混合物中进行聚合反应并持续1分钟至20分钟,从而合成与嵌套在所述至少一种MIP的所述第一区域和所述第二区域之间的所述靶核酸序列对应的序列,其中所合成的序列进一步连接以在聚合和或连接反应混合物中获得环化产物;以及任选地,以下项中的至少一者:c.使步骤b中获得的所述反应混合物进行酶消化并持续10分钟至45分钟,从而对存在于所述反应混合物中的线性MIP或核酸分子进行消化;以及d.对所述环化产物的所合成的序列进行扩增。

全文数据:

权利要求:

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