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申请/专利权人：中国医学科学院肿瘤医院

摘要：一种乳腺癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备及存储介质。该构建方法包括：获取多个乳腺癌样本集的转录组表达谱数据，其中，每个乳腺癌样本集包括多个乳腺癌样本；基于每个乳腺癌样本集的转录组表达谱数据，分析每个乳腺癌样本集中的每个乳腺癌样本的免疫浸润情况，并确定每个乳腺癌样本集中的第一免疫浸润组和第二免疫浸润组；基于每个乳腺癌样本集中的第一免疫浸润组和第二免疫浸润组的转录组表达数据，确定每个乳腺癌样本集中的第一免疫浸润组和第二免疫浸润组之间的差异表达基因；基于每个乳腺癌样本集中的第一免疫浸润组和第二免疫浸润组之间的差异表达基因，确定候选基因；以及基于候选基因，构建风险评分模型。

主权项：1.一种乳腺癌预后模型的构建方法，包括：获取多个乳腺癌样本集的转录组表达谱数据，其中，所述多个乳腺癌样本集中的每个乳腺癌样本集包括多个乳腺癌样本；基于所述每个乳腺癌样本集的转录组表达谱数据，分析所述每个乳腺癌样本集中的每个乳腺癌样本的免疫浸润情况，并确定所述每个乳腺癌样本集中的第一免疫浸润组和第二免疫浸润组；基于所述每个乳腺癌样本集中的所述第一免疫浸润组和所述第二免疫浸润组的转录组表达数据，确定所述每个乳腺癌样本集中的所述第一免疫浸润组和所述第二免疫浸润组之间的差异表达基因；基于所述每个乳腺癌样本集中的所述第一免疫浸润组和所述第二免疫浸润组之间的差异表达基因，确定候选基因；以及基于所述候选基因，构建风险评分模型，其中，所述乳腺癌预后模型包括所述风险评分模型，其中，基于所述每个乳腺癌样本集的转录组表达谱数据，分析所述每个乳腺癌样本集中的每个乳腺癌样本的免疫浸润情况，并确定所述每个乳腺癌样本集中的第一免疫浸润组和第二免疫浸润组，包括：基于所述每个乳腺癌样本集的转录组表达谱数据，采用单样本基因集富集分析对所述每个乳腺癌样本集中的每个乳腺癌样本的多种免疫浸润细胞的免疫浸润情况进行量化，并基于所述量化的结果对所述每个乳腺癌样本集中的所有乳腺癌样本进行相似性分析，以确定所述每个乳腺癌样本集中的第一免疫浸润组和第二免疫浸润组，基于所述候选基因，构建所述风险评分模型，包括：获取训练数据集；以及通过LASSO-Cox回归分析结合十折交叉验证法，对所述候选基因进行筛选，以确定用于构建所述风险评分模型的基因以及所述风险评分模型，其中，所述风险评分模型表示为：RS＝c1E1+…+cNEN，其中，RS表示风险评分，Ei表示用于构建所述风险评分模型的第i个基因的表达值，ci表示用于构建所述风险评分模型的第i个基因的系数，N表示用于构建所述风险评分模型的基因的数量，其中，用于构建所述风险评分模型的基因的数量为10，用于构建所述风险评分模型的基因包括C14orf79，C1orf168，C1orf226，CELSR2，FABP7，FGFBP1，IL-10，KLRB1，PLEKHO1和RAC2；所述风险评分模型表示为：RS＝EC14orf79×-0.114731735+EC1orf168×-0.019429183+EC1orf226×-0.049258060+ECELSR2×-0.055863001+EFABP7×-0.028295228+EFGFBP1×-0.008174118+EIL-10×0.020753075+EKLRB1×-0.121245004+EPLEKHO1×-0.049187024+ERAC2×-0.003657534，其中，EC14orf79表示基因C14orf79的表达值，EC1orf168表示基因C1orf168的表达值，EC1orf226表示基因C1orf226的表达值，ECELSR2表示基因CELSR2的表达值，EFABP7表示基因FABP7的表达值，EFGFBP1表示基因FGFBP1的表达值，EIL-10表示基因IL-10的表达值，EKLRB1表示基因KLRB1的表达值，EPLEKHO1表示基因PLEKHO1的表达值，ERAC2表示基因RAC2的表达值。

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百度查询： 中国医学科学院肿瘤医院 乳腺癌预后模型的构建方法及应用方法、电子设备