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提取关于蛋白质序列修饰的信息的方法 

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申请/专利权人:豪夫迈·罗氏有限公司

摘要:本发明公开了提取关于蛋白质中的蛋白质序列修饰的信息的方法。接收源自对来自至少两种酶促消化的肽所进行的质谱测量的蛋白质数据。鉴定候选序列修饰。确定所述候选序列修饰的、相比所述候选序列修饰的其余部分具有较高的代表真实序列修饰的平均概率的子集。候选序列修饰的所述子集的确定包括根据候选序列修饰位于被各自含有所述修饰的至少两种不同的肽物种所覆盖的氨基酸序列位置处来选择所述候选序列修饰的步骤。

主权项:1.一种提取关于蛋白质中的蛋白质序列修饰的信息的计算机实现方法,所述方法包括:接收至少部分地源自对通过对蛋白质的代表性样品的相应子样品进行的至少两种不同的酶促消化所获得的肽所进行的质谱测量的蛋白质数据;使用经接收的蛋白质数据鉴定所述蛋白质中的候选序列修饰;确定所述候选序列修饰的、相比所述候选序列修饰的其余部分具有较高的代表真实序列修饰的平均概率的子集;以及输出代表候选序列修饰的经确定的子集的数据,其中:候选序列修饰的所述子集的确定包括根据候选序列修饰位于被各自含有所述修饰的至少两种不同的肽物种所覆盖的氨基酸序列位置处来选择所述候选序列修饰的步骤。

全文数据:

权利要求:

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