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一种中晚期咽喉癌新辅助化疗敏感性预测模型构建方法 

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申请/专利权人:首都医科大学附属北京同仁医院

摘要:本发明提供一种中晚期咽喉癌新辅助化疗敏感性预测模型构建方法,通过识别新辅助化疗前中晚期咽喉癌患者中同时在敏感组和耐受组以及癌与癌旁正常组织中差异表达的基因,构建预测模型,该模型可在治疗前预测患者进行新辅助化疗的敏感性,进而识别化疗受益者,可为患者设计个体化治疗方案,精准施治,在保证或提高生存率的前提下,尽可能的保留患者咽喉功能,大大提高患者生活质量。目前此预测模型正在进行多中心前瞻性研究中,有助于将此模型进行更广泛的推广,更早实现临床转化。

主权项:1.一种中晚期咽喉癌新辅助化疗敏感性预测模型构建方法,其特征在于,包括如下步骤:步骤1,采集新辅助化疗前中晚期咽喉癌患者的癌组织和癌旁正常组织,进行RNA-seq测序分析,获取两者的差异表达基因;步骤2,获取步骤1的中晚期咽喉癌患者新辅助化疗后的敏感性信息,并根据敏感性信息将前述患者分为敏感组和耐受组,将敏感组和耐受组的癌组织进行RNA-seq测序分析,获取两者的差异表达基因;步骤3,将步骤1和步骤2获取的差异表达的基因进行比较并获得具有交集的差异基因;步骤4,采用随机森林模型对步骤3获得的具有交集的差异基因进行重要性排序,并绘制AUC曲线,筛选出AUC>0.8的基因;步骤5,将步骤4获得的基因通过qPCR进一步验证其相对表达,筛选与中晚期咽喉癌新辅助化疗敏感性相关的基因,构建预测模型。

全文数据:

权利要求:

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