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申请/专利权人：生物梅里埃公司
摘要：本发明涉及对样品进行宏基因组分析，以检测样品中感兴趣的物种的存在。分析是迭代进行的。在每次迭代过程中，识别和计数每个感兴趣的物种对应的序列。当感兴趣的物种的存在被确认或当执行了最大次数的迭代时，迭代停止。对感兴趣的物种进行检测后，可以对所述感兴趣的物种的基因组进行更精确的表征。表征实施补充迭代。
主权项：1.一种用于检测分析样品中可能存在的感兴趣的生物物种SOI的方法，所述感兴趣的生物物种具有已知的或部分已知的基因组，所述样品包含不同生物物种的混合物，所述方法包括以下步骤：-a向样品中加入对照物种SPC，所述对照物种具有已知的基因组，所述对照物种以已知的浓度CSPC加入至样品中；-b从样品中提取核酸；-c使用实时测序仪对步骤b中提取的核酸序列的一部分进行测序，进行预定的持续时间或直到获得预定数量的测序值；-d在步骤c之后，将步骤c产生的序列分配给感兴趣的物种和对照物种；-e更新分别与感兴趣的物种和对照物种相关的序列量使得与对照物种和感兴趣的物种相关的序列量为：·在步骤e的第一次迭代中，在步骤d中分配给对照物种和感兴趣的物种的序列量，加上初始序列量·在步骤e的每次重复中，在步骤d中分配给对照物种和感兴趣的物种的序列量加上前一次迭代产生的与对照物种和感兴趣的物种相关的序列量-f将步骤e中更新的与感兴趣的物种相关的序列量与序列数量的阈值SSOI进行比较和或将步骤e中更新的与对照物种相关的序列量与对照阈值SSPC进行比较；-g根据步骤f中进行的至少一次比较，检测样品中感兴趣的生物物种的存在，或继续进行步骤h；-h重复步骤c至g，直到达到迭代停止标准。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 生物梅里埃公司 通过迭代实时测序检测感兴趣的生物物种的存在的方法
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