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申请/专利权人：中国中医科学院广安门医院

摘要：本发明涉及基于空间转录组技术的芪珀生脉组合物改善房颤心肌纤维化的分析装置和方法，包括空间转录模块、表达变化差异基因筛选模块、降维处理模块、聚类分析模块、聚类差异基因集筛选模块、主要差异类群筛选模块和分析模块；采用空间转录组技术对正常组、模型组、芪珀生脉组动物心肌组织切片进行空间转录测序，利用空间转录测序数据进行后续分析，筛选高度变异基因、降维、聚类处理，对每个聚类的差异基因进行富集分析，比较富集分析结果，得到主要差异聚类，最后对主要差异聚类的特征差异基因在进行富集分析。利用本发明装置分析芪珀生脉药物干预、治疗房颤心肌纤维化的关键特征基因及相关分子信号通路，为更好地了解药物干预、治疗房颤提供了有效的分子理论基础和理论支持。

主权项：1.一种基于空间转录组技术的芪珀生脉组合物改善房颤心肌纤维化的分析装置，其特征是，包括：表达变化差异基因筛选模块，用于对正常组、房颤模型组、芪珀生脉给药组动物心房肌组织切片样本的空间转录数据进行标准化处理，并通过vst算法对标准化处理后的数据进行高度变异基因筛选，得到表达变化差异从高到低的表达变化差异基因集；降维处理模块，用于对正常组、房颤模型组、芪珀生脉给药组样本中筛选获得的表达变化差异基因集进行标准化处理后的数据采用PCA方法进行线性降维处理，获得PCA降维数据；然后采用T-SNE的非线性降维算法对PCA降维数据进行非线性降维处理，获得T-SNE降维数据；聚类分析模块，用于对降维处理数据采用SNN聚类算法进行聚类分析处理，获得正常组、房颤模型组、芪珀生脉给药组样本的表达变化差异基因聚类亚群；聚类差异基因集筛选模块，用于采用Seurat软件的wilcox秩和检验分别对正常组、房颤模型组、芪珀生脉给药组样本的每个聚类亚群的基因与对应组的组织样本的其他所有聚类亚群的基因进行差异比较，筛选获得每个聚类的差异基因集；主要差异类群筛选模块，用于采用R语言ClusterProfiler包分别对正常组、房颤模型组、芪珀生脉给药组样本的每个聚类的聚类差异基因集进行差异基因富集分析，并将正常组与房颤模型组、芪珀生脉给药组的富集分析结果进行比较，筛选获得主要差异类群；主要差异类群分析模块，用于对芪珀生脉给药组的主要差异类群与房颤模型组的主要差异类群的特征差异基因集进行差异基因功能富集分析，获得芪珀生脉组合物干预并改善房颤心肌纤维化的差异基因的相关生物学过程和信号通路。

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