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一种姜荷花全基因组SSR分子标记的多态性引物及其应用 

申请/专利权人:广东省农业科学院环境园艺研究所

申请日:2024-06-04

公开(公告)日:2024-07-05

公开(公告)号:CN118291672A

主分类号:C12Q1/6895

分类号:C12Q1/6895;C12Q1/6858;C12N15/11;G16B20/40;G16B25/20;G16B40/30;G16B50/00;G06K19/06

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.07.23#实质审查的生效;2024.07.05#公开

摘要:本发明属于生物技术领域,具体公开了一种姜荷花全基因组SSR分子标记的多态性引物及其应用,本发明基于姜荷花全基因组数据大量开发g‑SSR分子标记引物,筛选38对多态性较好的分子标记引物检测通用性,并对178份姜黄属种质资源进行扩增,开展遗传多样性和群体结构分析,最后构建姜黄属核心种质库和核心种质条形码;本发明开发的g‑SSR数量多、多态性强,在不同姜黄属种间的通用性好,实验结准确可靠,为姜黄属杂交育种、亲缘关系鉴定、物种演化等研究提供了新的工具。

主权项:1.一种姜荷花全基因组SSR分子标记的多态性引物,其特征在于,包括38对多态性引物,其引物的核苷酸序列如下所示:CagSSR2的正向引物如SEQIDNO.1所示,反向引物如SEQIDNO.2所示;CagSSR4的正向引物如SEQIDNO.3所示,反向引物如SEQIDNO.4所示;CagSSR16的正向引物如SEQIDNO.5所示,反向引物如SEQIDNO.6所示;CagSSR32的正向引物如SEQIDNO.7所示,反向引物如SEQIDNO.8所示;CagSSR41的正向引物如SEQIDNO.9所示,反向引物如SEQIDNO.10所示;CagSSR54的正向引物如SEQIDNO.11所示,反向引物如SEQIDNO.12所示;CagSSR71的正向引物如SEQIDNO.13所示,反向引物如SEQIDNO.14所示;CagSSR72的正向引物如SEQIDNO.15所示,反向引物如SEQIDNO.16所示;CagSSR80的正向引物如SEQIDNO.17所示,反向引物如SEQIDNO.18所示;CagSSR83的正向引物如SEQIDNO.19所示,反向引物如SEQIDNO.20所示;CagSSR84的正向引物如SEQIDNO.21所示,反向引物如SEQIDNO.22所示;CagSSR89的正向引物如SEQIDNO.23所示,反向引物如SEQIDNO.24所示;CagSSR104的正向引物如SEQIDNO.25所示,反向引物如SEQIDNO.26所示;CagSSR105的正向引物如SEQIDNO.27所示,反向引物如SEQIDNO.28所示;CagSSR110的正向引物如SEQIDNO.29所示,反向引物如SEQIDNO.30所示;CagSSR127的正向引物如SEQIDNO.31所示,反向引物如SEQIDNO.32所示;CagSSR128的正向引物如SEQIDNO.33所示,反向引物如SEQIDNO.34所示;CagSSR138的正向引物如SEQIDNO.35所示,反向引物如SEQIDNO.36所示;CagSSR143的正向引物如SEQIDNO.37所示,反向引物如SEQIDNO.38所示;CagSSR147的正向引物如SEQIDNO.39所示,反向引物如SEQIDNO.40所示;CagSSR150的正向引物如SEQIDNO.41所示,反向引物如SEQIDNO.42所示;CagSSR155的正向引物如SEQIDNO.43所示,反向引物如SEQIDNO.44所示;CagSSR161的正向引物如SEQIDNO.45所示,反向引物如SEQIDNO.46所示;CagSSR173的正向引物如SEQIDNO.47所示,反向引物如SEQIDNO.48所示;CagSSR181的正向引物如SEQIDNO.49所示,反向引物如SEQIDNO.50所示;CagSSR191的正向引物如SEQIDNO.51所示,反向引物如SEQIDNO.52所示;CagSSR194的正向引物如SEQIDNO.53所示,反向引物如SEQIDNO.54所示;CagSSR195的正向引物如SEQIDNO.55所示,反向引物如SEQIDNO.56所示;CagSSR207的正向引物如SEQIDNO.57所示,反向引物如SEQIDNO.58所示;CagSSR209的正向引物如SEQIDNO.59所示,反向引物如SEQIDNO.60所示;CagSSR215的正向引物如SEQIDNO.61所示,反向引物如SEQIDNO.62所示;CagSSR228的正向引物如SEQIDNO.63所示,反向引物如SEQIDNO.64所示;CagSSR235的正向引物如SEQIDNO.65所示,反向引物如SEQIDNO.66所示;CagSSR245的正向引物如SEQIDNO.67所示,反向引物如SEQIDNO.68所示;CagSSR246的正向引物如SEQIDNO.69所示,反向引物如SEQIDNO.70所示;CagSSR254的正向引物如SEQIDNO.71所示,反向引物如SEQIDNO.72所示;CagSSR272的正向引物如SEQIDNO.73所示,反向引物如SEQIDNO.74所示;CagSSR285的正向引物如SEQIDNO.75所示,反向引物如SEQIDNO.76所示。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 广东省农业科学院环境园艺研究所 一种姜荷花全基因组SSR分子标记的多态性引物及其应用

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