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基于基因、药物原子相互作用关系提取方法的药物靶点、药物关键药效团检测方法 

申请/专利权人:浙江大学

申请日:2024-04-10

公开(公告)日:2024-07-05

公开(公告)号:CN118298910A

主分类号:G16B15/30

分类号:G16B15/30;G16B20/50;G06F18/213;G06F18/15;G06F18/2415

优先权:

专利状态码:在审-实质审查的生效

法律状态:2024.07.23#实质审查的生效;2024.07.05#公开

摘要:本发明公开了一种基于基因、药物原子相互作用关系提取方法的药物靶点、药物关键药效团检测方法,包括:构建药物敏感性数据库;构建细胞系特征提取器和药物特征提取器;采用交叉注意力算法构建细胞系特征‑药物特征融合器,结合细胞系特征提取器、药物特征提取器、基于线性层构建的预测器,搭建药物敏感性预测模型;训练并优化药物敏感性预测模型的参数,得到优化后的药物敏感性预测模型;输入到优化后的药物敏感性预测模型中,输出预测结果,并进行可解释性分析,检测非小细胞肺癌的药物靶点和药物的关键药效团。本发明实现了药物敏感性预测精度的提升,并实现了深度学习模型的可解释性。

主权项:1.一种基于基因、药物原子相互作用关系提取方法的药物靶点、药物关键药效团检测方法,其特征在于,包括以下步骤:1构建药物敏感性数据库,包括获取细胞系-药物对的半抑制浓度数据、药物ID和细胞系的ID以及根据细胞系的ID获取细胞系多组学数据、细胞系多组学数据经预处理得到的细胞系多组学数据矩阵、根据药物ID获取的药物SMILES序列;2构建细胞系特征提取器和药物特征提取器;3采用交叉注意力算法构建细胞系特征-药物特征融合器,细胞系特征-药物特征融合器结合细胞系特征提取器、药物特征提取器和基于线性层构建的预测器,搭建药物敏感性预测模型;4采用步骤1构建的药物敏感性数据库,训练并优化药物敏感性预测模型的参数,得到优化后的药物敏感性预测模型;5将待预测的非小细胞肺癌、乳腺癌的细胞系多组学数据和药物SMILES序列输入到优化后的药物敏感性预测模型中,输出非小细胞肺癌和乳腺癌细胞系的药物敏感性预测结果,并进行可解释性分析,检测非小细胞肺癌的药物靶点和药物的关键药效团。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 浙江大学 基于基因、药物原子相互作用关系提取方法的药物靶点、药物关键药效团检测方法

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