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申请/专利权人：云南省烟草农业科学研究院
摘要：本发明属于烟草免疫与系统性抗性改良技术领域，具体涉及一种抗烟草疫霉菌的系统性mRNA筛选分析方法及应用。所述方法选择高抗和高感烟草品种分别进行嫁接，并对接种前后各嫁接体的砧穗组织进行转录组测序，鉴定砧穗间双向运输mRNA并对其进行GO富集，初步筛选与抗病响应紧密相关的多个候选mb‑mRNAs，然后对候选mb‑mRNAs进行基因结构预测、蛋白结构域预测和同源基因基因分析，获得1个与已知的PR1基因高度同源的Scaffold5.820基因，对烟草疫霉菌胁迫中起重要的信号调控作用。本发明对高抗与高感品种嫁接后是否能触发高感品种产生对烟草疫霉菌的耐受性以及在砧木和接穗间是否存在大量的双向移动mRNAs长距离交流及介导整株植物的免疫防御反应进行研究，填补当前研究的空白。
主权项：1.一种抗烟草疫霉菌的系统性mRNA筛选分析方法，其特征在于，包括如下步骤：S1：选择高抗和高感烟草疫霉菌的烟草品种进行全基因组测序，得到两个烟草品种的参考基因组信息；S2：以S1选择的高抗和高感烟草疫霉菌的烟草品种分别作为接穗或砧木进行嫁接得到4种嫁接体；S3：对S2得到的各嫁接体接种烟草疫霉菌，接种前分别提取各嫁接体砧木和接穗的总RNA；S4：对S3接种后不同时间点的各嫁接体烟草疫霉菌抗性进行鉴定和评价，并在接种后的不同时间点分别提取各嫁接体砧木和接穗的总RNA；S5：对S3中和S4中提取的总RNA分别进行转录组测序，得到各嫁接体接种前和接种后不同时间点接穗和砧木的转录组信息；采用已构建生物信息学分析方法结合S1中的参考基因组信息和接种前后各嫁接体不同时间点接穗和砧木的转录组信息，鉴定砧穗间双向运输mRNA；S6：对S5得到的mRNA进行GO富集分析，初步筛选获得与抗病响应紧密相关的多个候选mb-mRNAs；S7：对S6得到的候选mb-mRNAs进行基因结构预测、蛋白结构域预测和同源基因基因分析，其中包含一个与已知的PR1基因高度同源的Scaffold5.820基因，对烟草疫霉菌胁迫中起重要的信号调控作用。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 云南省烟草农业科学研究院 一种抗烟草疫霉菌的系统性mRNA筛选分析方法及应用
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