申请/专利权人：广东省农业科学院蔬菜研究所

申请日：2024-03-12

公开（公告）日：2024-06-25

公开（公告）号：CN117887893B

主分类号：C12Q1/6895

分类号：C12Q1/6895;C12N15/11;A01H1/04

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.06.25#授权;2024.05.03#实质审查的生效;2024.04.16#公开

摘要：本发明公开了一种与冬瓜种子大小紧密连锁的KASP分子标记，根据冬瓜基因组第10染色体上第16823593位SNP位点设计，该SNP位点存在GC的碱基突变，其中G:G和G:C基因型表现为大种子的基因型，C:C基因型表现为小种子的基因型。还公开了一种检测所述KASP分子标记的引物和试剂盒以及利用所述引物鉴定冬瓜种子大小的方法，还公开了检测上述分子标记的试剂、引物、试剂盒或方法在苗期鉴定冬瓜种子大小表型以及冬瓜分子标记辅助育种中的应用。本发明中的引物或试剂盒可在苗期快速鉴定冬瓜的种子大小表型，并具有准确、快速、成本低、鉴定周期短、操作简便等优点，能够辅助冬瓜新品种选育，具有广阔的应用前景。

主权项：1.一种冬瓜种子大小的鉴定方法，其特征在于，包括以下步骤：（1）提取待测冬瓜的DNA；（2）采用检测与冬瓜种子大小紧密连锁的KASP分子标记的引物或试剂盒进行PCR扩增，得到PCR产物；所述引物包括两条特异性上游引物BhSSA1和BhSSA2，以及一条通用下游引物BhSSC1，其中所述上游引物BhSSA1的核苷酸序列如SEQIDNO.1所示，所述上游引物BhSSA2的核苷酸序列如SEQIDNO.2所示，所述下游引物BhSSC1的核苷酸序列如SEQIDNO.3所示，所述上游引物BhSSA1的5’端添加有FAM荧光标签序列，所述上游引物BhSSA2的5’端添加有HEX荧光标签序列；所述KASP分子标记根据冬瓜基因组第10染色体上第16823593位的SNP位点设计，该SNP位点存在GC的碱基突变，对应的基因型包括G:G、G:C和C:C，其中G:G和G:C基因型表现为大种子的基因型，C:C基因型表现为小种子的基因型，所述KASP分子标记通过如SEQIDNO.1~SEQIDNO.3所示的引物扩增得到；其中冬瓜基因组的版本号为Benincasahispidacv.B227；所述试剂盒包括所述引物；（3）所述PCR产物经荧光检测后进行基因分型，所述KASP分子标记的分型中，基因型为G:G类型，判定为大种子纯合材料；基因型为G:C类型，判定为大种子杂合材料；基因型为C:C，判定为小种子纯合材料。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 广东省农业科学院蔬菜研究所 一种与冬瓜种子大小紧密连锁的KASP分子标记及其应用

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