申请/专利权人：吴安华

申请日：2021-06-08

公开（公告）日：2024-06-18

公开（公告）号：CN113421613B

主分类号：G16B40/00

分类号：G16B40/00;G16B15/30;G16B25/00;G16B50/30;G16H10/20;G16H50/20;G16H70/40;C12Q1/6869

优先权：

专利状态码：有效-授权

法律状态：2024.06.18#授权;2021.10.12#实质审查的生效;2021.09.21#公开

摘要：一种基于铁死亡水平评价胶质母细胞瘤患者免疫治疗反应性的系统及分析方法，属于免疫治疗反应性分析技术领域。这种基于铁死亡水平评价胶质母细胞瘤患者免疫治疗反应性的系统包括输入模块、分析模块和输出模块。通过总结来自四个独立数据库的1,750名胶质瘤患者的数据建立了这种基于铁死亡水平评价胶质瘤患者免疫治疗反应性的系统，该系统通过计算和比较铁死亡水平，能够预测胶质瘤恶性进展、预后生存期长短、抗肿瘤免疫力的高低以及免疫治疗的反应性。同时，该系统还能够预测通过抑制铁死亡水平是否可改善免疫治疗的功效，能够辅助性的为临床分析及应用作出指导。

主权项：1.一种基于铁死亡水平评价胶质母细胞瘤患者免疫治疗反应性的系统，它包括输入模块、分析模块和输出模块，其特征在于，所述输入模块用于输入待测样本的转录组测序数据；所述分析模块以待测样本的铁死亡特征性基因集的基因表达数据为输入，采用ssGSEA算法计算待测样本的铁死亡评分，并将待测样本的铁死亡评分与对照值进行比较，以大于或小于对照值确定待测样本的免疫治疗反应性和是否具有免疫抑制性微环境；所述输出模块用于输出待测样本的免疫治疗反应性和是否具有免疫抑制性微环境的结果；所述铁死亡特征性基因集包含ACSL1、ACSL3、ACSL4、ACSL5、ACSL6、ALOX15、ATG5、ATG7、CP、CYBB、FTH1、FTL、FTMT、GCLC、GCLM、GPX4、GSS、HMOX1、LPCAT3、MAP1LC3A、MAP1LC3B、MAP1LC3C、NCOA4、PCBP1、PCBP2、PRNP、SAT1、SAT2、SLC11A2、SLC39A14、SLC39A8、SLC3A2、SLC40A1、SLC7A11、STEAP3、TF、TFRC、TP53、VDAC2和VDAC3；所述对照值采用以下步骤确定：a）获取样本数据集，以CGGA、TCGA、GSE6011和Rembrandt四个胶质瘤数据库的1750例数据作为样本数据集，所述1750例数据包含每例样本的基因表达数据；b）计算铁死亡评分，以样本数据集的铁死亡特征性基因集的基因表达数据为输入，用ssGSEA算法计算步骤a中每例样本的铁死亡评分；c）确定对照值，计算步骤b中所有胶质母细胞瘤患者铁死亡评分的中位值作为对照值；d）将得到的胶质母细胞瘤患者的铁死亡评分与对照值进行比较，如果高于对照值，确定该胶质母细胞瘤患者具有免疫抑制性微环境，使用铁死亡抑制剂ferrostatin-1激活其免疫微环境，如果低于对照值，确定该胶质母细胞瘤患者的免疫微环境为激活状态，对免疫调控点靶向治疗敏感。

全文数据：

权利要求：

百度查询： 吴安华 一种基于铁死亡水平评价胶质母细胞瘤患者免疫治疗反应性的系统及分析方法

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