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一种检测BCR-ABL激酶区突变的引物探针组合及其应用 

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申请/专利权人:迈杰转化医学研究(苏州)有限公司

摘要:本发明提供了一种检测BCR‑ABL激酶区突变的引物探针组合及其应用,所述引物探针组合包括检测BCR‑ABL激酶区突变位点的引物和探针;所述突变位点包括Y253H、E255K、E255V、V299L、T315A、T315I、F317L、F317I、F317V、F317C、F359V、F359I和F359C的组合。本发明所述引物探针组合可以同时检测BCR‑ABL激酶区基因的13种点突变,多于以往少于10种突变的检测。所述引物探针组合特异性良好,可以一次性检测多个突变位点。可用于辅助医生针对一代TKI耐药的慢性粒细胞白血病患者制定治疗方案。

主权项:1.一种检测BCR-ABL激酶区突变的引物探针组合,其特征在于,所述引物探针组合包括检测BCR-ABL激酶区突变位点的引物和探针;所述突变位点为Y253H、E255K、E255V、V299L、T315A、T315I、F317L、F317I、F317V、F317C、F359V、F359I和F359C的组合;通过特异性ARMS引物和探针的优化得到下列引物和探针:检测突变位点T315I的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:1,下游引物SEQIDNO:2,探针SEQIDNO:3;检测突变位点V299L的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:4,下游引物SEQIDNO:2,探针SEQIDNO:3;检测突变位点F359I的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:5,下游引物SEQIDNO:6,探针SEQIDNO:7;检测突变位点F359V的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:8,下游引物SEQIDNO:6,探针SEQIDNO:7;检测突变位点F359V和F359I的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:9,下游引物SEQIDNO:6,探针SEQIDNO:7;检测突变位点F359C的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:10,下游引物SEQIDNO:6,探针SEQIDNO:7;检测突变位点F317L的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:11,下游引物SEQIDNO:12,探针SEQIDNO:3;检测突变位点F317V的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:13,下游引物SEQIDNO:12,探针SEQIDNO:3;检测突变位点F317L和F317V的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:14,下游引物SEQIDNO:12,探针SEQIDNO:3;检测突变位点F317I的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:15,下游引物SEQIDNO:12,探针SEQIDNO:3;检测突变位点F317C的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:16,下游引物SEQIDNO:12,探针SEQIDNO:3;检测突变位点T315A的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:17,下游引物SEQIDNO:12,探针SEQIDNO:3;检测突变位点Y253H的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:18,下游引物SEQIDNO:19,探针SEQIDNO:20;检测突变位点E255K的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:21,下游引物SEQIDNO:22,探针SEQIDNO:23;检测突变位点E255V的引物和探针包括:上游引物SEQIDNO:21,下游引物SEQIDNO:24,探针SEQIDNO:23。

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