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申请/专利权人:丽水市质量检验检测研究院
摘要:本发明涉及一种基于ttr基因的沙门氏菌检测试剂盒及非诊断性检测方法,试剂盒含有以下特异性引物:上游外引物F3如SEQIDNO.1所示,下游外引物B3如SEQIDNO.2所示,上游内引物FIP如SEQIDNO.3所示,下游内引物BIP如SEQIDNO.4所示,上游环引物LF如SEQIDNO.5所示,下游环引物LB如SEQIDNO.6所示。本发明设计一条特有的LAMP引物对沙门氏菌进行检测,同时结合短时间增菌和MPN计数建立了mini‑MPN‑LAMP沙门氏菌快速定量检测方法;本发明灵敏度高,特异性好,操作简单快速,准确可靠,检测成本低。
主权项:1.一种基于ttr基因的沙门氏菌检测试剂盒的非诊断性检测方法,其特征在于包括下述步骤:(1)制作检测沙门氏菌的环介导等温扩增试剂盒;配制LAMP反应液:LAMP反应体系为:10XThermoPolBuffer2μL,MgSO41.2μL,dNTPMixture2.8μL,50XLAMP荧光染料0.2μL,ROX参比荧光染料0.2μL,10XPrimersMix2μL,Bst2.0WarmStartDNA聚合酶0.8μL,DNA粗提液5μL,加无RNA酶水至20μL;反应条件:65℃保温反应40min,以1min作1个循环检测荧光值,结束后按65~95℃,0.2℃s测定溶解曲线;其中,试剂盒含有以下特异性引物:上游外引物F3如SEQIDNO.1所示,下游外引物B3如SEQIDNO.2所示,上游内引物FIP如SEQIDNO.3所示,下游内引物BIP如SEQIDNO.4所示,上游环引物LF如SEQIDNO.5所示,下游环引物LB如SEQIDNO.6所示;(2)样品制备和DNA提取;(a)样品的前处理:无菌操作称取25g或25ml样品,置于盛有225mLBPW的无菌均质杯或合适容器内,均质2~3min;若样品为液态,不需要均质,振荡混匀;使用BPW增菌液对样品均液进行10倍梯度稀释,取3个浓度,每个浓度分别取1mL至3个离心管,置于36℃增菌5h后分别进行DNA提取;(b)待测样品模板DNA的制备:(b-1)对照标准菌株菌液制备:阳性对照:婴儿沙门氏菌CICC21649;阴性对照:大肠埃希氏菌CICC24188,标准菌株接种于血平板中36℃培养24h进行活化,再接种于BPW培养基中36℃培养16h得到新鲜菌液;(b-2)样品与对照菌株的模板DNA制备:采用快速煮沸法提取核酸:吸取1mL样液于12000rmin离心5min,移去上清液900μL,加入1mL无菌水后混匀再12000rmin离心5min,移去上清液900μL,置于100℃电热板中加热15min,迅速冷却后12000rmin离心1min,移取上清液直接用于LAMP实验;上清即作为模板DNA;(3)进行沙门氏菌的环介导等温扩增反应:按照LAMP反应体系对每个提取样品进行检测,依次确证沙门氏菌阳性管数;LAMP反应体系:10XThermoPolBuffer2μL,MgSO41.2μL,dNTPMixture2.8μL,50XLAMP荧光染料0.2μL,ROX参比荧光染料0.2μL,10XPrimersMix2μL,Bst2.0WarmStartDNA聚合酶0.8μL,DNA粗提液5μL,加无菌水至20μL;反应条件:65℃保温反应40min,以1min作1个循环检测荧光值,结束后按65~95℃,0.2℃s测定溶解曲线;检测反应体系:WarmStartLAMP变色预混液10μL,10XPrimerMix2μL,加水至15μL,反应前加入样品DNA提取液5μL;使用金属浴65℃加热保温40min,观察样品颜色的变化;颜色变黄则表示检出沙门氏菌;(4)沙门氏菌MPN的报告:按照确证的沙门氏菌阳性管数,检索MPN表,报告每g或每mL样品中沙门氏菌的MPN值;试剂盒的理论检出限为3.6CFUmL。
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