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申请/专利权人：北京中医药大学

摘要：本发明提供一组叶绿体基因组多态性区域以及利用该多态性区域制备的DNA条形码，所述多态性区域可用于鉴别大黄种质资源，所述DNA条形码可用于植物种子批次防伪，通过本发明提供的技术方案，可实现为优质植物品种及其种子的双重防伪，达到品种识别及科学的种子管理的唯一性、可识别性、可追溯性。

主权项：1.一种大黄叶绿体基因组多态性区域作为大黄近源品种种质鉴别用DNA条形码的应用，其特征在于，所述多态性区域为trnH-GUG_psbA基因多态性间区，所述种质包括对大黄样品基原、产地、质量和真伪的鉴别,所述应用为通过对近源品种大黄样本trnH-GUG_psbA基因多态性间区进行检测，根据不同近源品种大黄的trnH-GUG_psbA基因单倍型来确认样本的种质，所述trnH-GUG_psbA基因单倍型区分如下：第一类突变位点主要分布在trnH-GUG_psbA扩增片段上36bp-360bp，共有6个单倍型，单倍型Hap2在trnH-GUG_psbA扩增片段上的179和218位的特异性碱基为C和A；Hap3在trnH-GUG_psbA扩增片段上36-42位存在插入序列CTTTAAA；单倍型Hap4在trnH-GUG_psbA扩增片段上139位的特异性碱基为A；单倍型Hap5在trnH-GUG_psbA扩增片段上286和952位的特异性碱基分别位T和A；单倍型Hap6在trnH-GUG_psbA扩增片段上39、49位的特异性碱基分别为G和A；所述trnH-GUG_psbA扩增片段采用特异性引物trnH-GUG_psbA-F：CGGGCGAACGACGGGAATTG；trnH-GUG_psbA-R：ATACTGTCGAATAACAAGCC，通过PCR扩增得到trnH-GUG_psbA片段；第二类突变位点379-404，其中在trnH-GUG_psbA扩增片段上379、381-385、387、389及391-392、394、396、399、400-402和404位的特异性碱基都为C、A、T、T、T、T、T、C、T、T、G、C、G、G、G、T；除此之外，单倍型Hap8在trnH-GUG_psbA扩增片段上的其他特异性碱基在199、200和952位都为A；单倍型Hap9在trnH-GUG_psbA扩增片段上的其它特异性碱基在219和352位，分别为T和C；单倍型Hap10在trnH-GUG_psbA扩增片段上的其它特异性碱基在274-280位间缺失；单倍型Hap11在trnH-GUG_psbA扩增片段上的其它特异性碱基在128和304位都为T；单倍型Hap12在trnH-GUG_psbA扩增片段上的其它特异性碱基在49和219位，分别为A和C；单倍型Hap13在trnH-GUG_psbA扩增片段上的其他特异性碱基在295位为A；各产地单倍型如下：掌叶大黄聚为两个大支，药用大黄和唐古特大黄分别聚于其中的一支；其中河南省洛阳市药用大黄为单倍型Hap5、湖北省宜昌市药用大黄为Hap3，四川省绵阳市药用大黄为Hap6，云南省昆明市药用大黄为Hap12，唐古特大黄青海省海北州祁连县药用大黄为Hap7和Hap8,青海省果洛藏族自治州药用大黄为Hap9；四川省甘孜州炉霍县掌叶大黄为Hap10，甘肃省陇南市宕昌县掌叶大黄为Hap11，四川省甘孜州理塘县掌叶大黄为Hap2，陕西省宝鸡市陇县掌叶大黄为Hap4；进一步的，根据基因型的种类和数目对大黄产地鉴别。

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百度查询： 北京中医药大学 一种基于大黄叶绿体基因组多态性区域制备的条形码及其应用