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基于二代测序的微生物16SrRNA基因多区域扩增引物组合及其应用方法 

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申请/专利权人:杭州跃真生物科技有限公司

摘要:本发明属于生物技术领域,具体公开了基于二代测序的微生物16SrRNA基因多区域扩增引物组合及其应用方法,包括P1F~P8F以及P1R~P8R,其中,P1F~P8F为上游引物,P1R~P8R为下游引物,实现短读长序列PE150覆盖16SrRNA基因多个多可变区域。本发明引物组的改进具体体现在1筛选的引物组对于细菌界九个主要的门其综合覆盖率超过90%;2筛选的引物组内各引物在扩增过程中产生的PCR嵌合体读数小于35%;3筛选的引物组内各引物的PCR扩增反应条件相同,并与多样本混合方案相配套;4筛选的引物进行扩增和文库构建后,文库片段大小在450bp左右,使用短读长序列PE150即可覆盖全部序列信息,见摘要附图。基于此,本发明是一种低成本,微量,高通量的多重PCR建库方案,具有覆盖细菌种类多,分辨率高,操作简单,成本较低等特点。

主权项:1.基于二代测序的微生物16SrRNA基因多区域扩增引物组合,其特征在于:包括:P1FACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNTAGYGGCGNACGGGTGAGTAA;P1RGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNTCYNACTGCTGCCTCCCGTAG;P2FACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNATCCTACGGGAGGCAGCAGT;P2RGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNAATCGATTACCGCGGCTGCT;P3FACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNGCCGGATAAYTGGGYDTAAAGNG;P3RGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNTATCCGGCAGGGTATCTAATCCT;P4FACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNCGAATTGACGGGGRCCCG;P4RGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNACGTCATCCMCACCTTCCTC;P5FACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNAACCAGGTAGGATTAGATACCCT;P5RGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNACCTGGTTCCGTCAATTCMTTTGAGTTT;P6FACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNTTCCAAGAGTTTGATCMTGGCTCAG;P6RGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNATTACTCACCCGTICGCCRCT;P7FACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNAAGAAGGYAACGAGCGCAACC;P7RGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNTTGGCGGGAACGTATTCACC;P8FACACTCTTTCCCTACACGACGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNTGCGGCGTACACACCGC;P8RGTGACTGGAGTTCAGACGTGTGCTCTTCCGATCTNNNNNNNNCGCAACTACCTTGTTACGACTT;其中,P1F~P8F为上游引物,结构为IlluminaTruseq文库序列read1-8N-16Sforward引物,P1R~P8R为下游引物,结构为IlluminaTruseq文库序列read2-8N-16Sreverse引物图2,且上游引物和下游引物等摩尔数混合,8个N为内部barcode,用于区分同一次测序的不同的样本。

全文数据:

权利要求:

百度查询: 杭州跃真生物科技有限公司 基于二代测序的微生物16SrRNA基因多区域扩增引物组合及其应用方法

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