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基于MRP2/3的何首乌中肝毒性化合物的快速筛选方法 

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申请/专利权人:中国食品药品检定研究院

摘要:本发明涉及一种基于计算机分子对接技术的何首乌中肝毒性化合物的筛选方法,其包括以下步骤:1获得何首乌中至少一种待检化合物的三维化学结构;2获得MRP2、MRP3的蛋白同源模建结构,并分别确定MRP2和MRP3的活性位点;3将所述待检化合物、具有MRP2抑制效应的阳性化合物1、具有MRP3抑制效应的阳性化合物2分别与所述活性位点进行计算机分子对接,获得对接打分;4所述待检化合物判定为肝毒性化合物的条件是:所述待检化合物的对接打分达到对接判定值。本发明的筛选方法快速、经济,操作简单,而且可实现众多化合物的高通量筛选。

主权项:1.一种基于计算机分子对接技术的何首乌中肝毒性化合物的筛选方法,其包括以下步骤:(1)获得何首乌中至少一种待检化合物的三维化学结构;(2)获得MRP2、MRP3的蛋白同源模建结构,并分别确定MRP2和MRP3的活性位点;所述蛋白同源模建结构采用PDB数据库中编号为6uy0的蛋白同源模建结构;MRP2活性位点根据关键氨基酸位点LYS295、VAL434、SER481、SER484、LYS485、ILE583、SER594、SER602、MET603、THR1144、ARG1146、CYS1196、ASN1253、ARG1257、SER1260、GLU1261定义;MRP3活性位点根据关键氨基酸位点GLN321、GLN363、THR1237、PHE1238、TRP1242、ARG1245定义;所述MRP2活性位点定义为:半径为17.423870Å,位点的三维坐标位置为157.158707,176.372707,163.243586;所述MRP3活性位点定义为:半径为15.173382Å,位点的三维坐标位置为171.206066,173.948148,165.653377;(3)将所述待检化合物、具有MRP2抑制效应的阳性化合物1、具有MRP3抑制效应的阳性化合物2分别与所述活性位点进行计算机分子对接,获得对接打分;所述具有MRP2抑制效应的阳性化合物1是吲哚美辛或胆红素;所述具有MRP3抑制效应的阳性化合物2是伊马替尼或胆红素;(4)所述待检化合物判定为肝毒性化合物的条件是:所述待检化合物的对接打分达到对接判定值。

全文数据:

权利要求:

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