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一种濒危植物疏花水柏枝野外适生区模拟的方法 

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申请/专利权人:中国长江三峡集团有限公司

摘要:本发明提供一种濒危植物疏花水柏枝野外适生区模拟的方法,包括采集地理信息,收集环境数据,数据分析方法,野外适生区的模拟,设置其训练模型所用的正则化乘数和环境特征组合来选择最佳模型,默认参数为RM=1,FC包括5种矩阵算法,分别为线性型、二次型、片段化、乘积型和阈值型;在R语言4.2.1软件中调用Kuenm数据包设置10个梯度;FC设置6个类型环境特征组合;利用受试工作特征曲线ROC下的面积值AUC评估模型预测结果的准确性,地图使用DIVA‑GIS7.5软件自带地图。通过珍稀濒危植物野外适生区的模拟技术,选取残存和灭绝的不同居群疏花水柏枝分布数据和环境因子数据,模拟疏花水柏枝不同气候时期的分布情况,预测疏花水柏枝自末次间冰期以来对环境因子的响应。

主权项:1.一种濒危植物疏花水柏枝野外适生区模拟的方法,其特征在于,包括如下步骤:(1)采集地理信息在植物本底调查的基础上,收集濒危植物疏花水柏枝残存和灭绝居群的采样地点经纬度和海拔高度,统一用GPS仪测定,在EXCEL中转化成十进制数据,保存为csv格式;(2)收集环境数据气候变量数据从世界气候数据库下载海拔数据和空间分辨率为30s的19个生物气候变量数据,获取末次间冰期、末次盛冰期、现今时期和未来4个时期的气候数据,添加包括气候因子、水位、植被类型、坡度、土壤理化性质的环境因子,为提高模型的精确性,利用R语言4.2.1软件中的corrplot软件包对环境因子变量进行相关性分析并制图,删减相关性|r|≥0.70的环境因子,余下环境因子用于后续优化模拟;(3)数据分析方法将物种地理信息和环境数据文件夹整合,选择不同时期的气候因子,气候因子的变量名与环境因子变量名保持一致,使用刀切法对单个环境因子逐一运行以及使用全部环境因子运行得出结果后,绘制响应曲线和制作预测图,比较训练增益值,测试增益值和AUC值之间的差异,来了解在疏花水柏枝的分布中重要的环境因子使用刀切法对单个环境因子逐一运行以及使用全部环境因子运行得出结果后,绘制响应曲线和制作预测图,测定各环境因子变量权重,预测气候变暖或冰期条件下物种分布区的变化;(4)野外适生区的模拟设置其训练模型所用的正则化乘数RM和环境特征组合FC来选择最佳模型,默认参数为正则化乘数RM=1,环境特征组合FC包括5种矩阵算法,分别为线性型L、二次型Q、片段化H、乘积型P和阈值型T;在R语言4.2.1软件中调用Kuenm数据包设置RM=0.5、1.0、1.5、2.0、2.5、3.0、3.5、4.0、4.5、5.0,共10个梯度;FC=L、LQ、H、LQH、LQHP、LQHPT,共6个类型环境特征组合;利用受试工作特征曲线ROC下的面积值AUC评估模型预测结果的准确性,AUC=0.5~0.6、0.6~0.7、0.7~0.8、0.8~0.9、0.9~1,分别表示模拟效果失败、较差、一般、准确、非常准确,地图使用DIVA-GIS7.5软件自带地图,并作预测结果的输出和统计分析。

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