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基于LAMP-CRISPR/Cas12a系统宋内氏志贺氏菌的快速检测方法 

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申请/专利权人:河南牧业经济学院

摘要:本发明提供一种基于CRISPRCas12a系统结合环介导等温扩增LAMP快速检测宋内氏志贺氏菌的方法,属于微生物检测领域。本发明利用CRISPR系统Ⅱ类Ⅴ型的Cas12a蛋白对特定核酸DNA切割产生的“附属切割”活性,设计荧光报告探针,实现对宋内氏志贺菌特异致病基因的LAMP扩增产物的快速检测。本发明所述方法仅需要恒温装置和简易的荧光检测装置,即可实现1小时内完成检测,检测结果可通过裸眼判定,简便、灵敏、高效地实现现场检测,所述方法在食品安全、生物检测以及市场监管等领域具有广阔的应用前景。

主权项:1.基于LAMP-CRISPRCas12a系统宋内氏志贺氏菌的快速检测方法,其特征在于,包括以下步骤:1提取待测样品的基因组DNA;2针对特异致病基因保守序列设计sgRNA,包含sgRNA的PCR引物,采用PCR结合LbCpfl酶切方法筛选得到目标sgRNA;3设计LAMP引物,以步骤1提取的基因组DNA作为模板,进行LAMP扩增;4以步骤1提取的基因组DNA作为模板,步骤2设计的PCR引物,扩增特异致病基因IpaH,构建至pMD-19T克隆载体,构建pMD19T-IpaH质粒;以十倍比例倍比稀释质粒作为LAMP扩增的模板;5荧光可视检测,将LAMP扩增产物、LbCpf1、荧光探针、目标sgRNA、NEBBuffer2.1混匀,孵育10~30min,在蓝光或紫外光下裸眼可视对样品中宋内氏志贺氏菌的定性检测。

全文数据:

权利要求:

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