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申请/专利权人：南京农业大学
摘要：本发明公开了一种基于16SrRNA扩增子测序检测土壤致病细菌生物污染的方法，其包括步骤为：步骤一、构建土壤非冗余致病细菌数据库；步骤二、完成对土壤植物样品DNA的提取；步骤三、完成样品的16SrRNA基因测序，获得测序下机数据；步骤四、采用DADA2分析流程封装土壤非冗余致病细菌库，获得代表性序列；步骤五、将代表性序列与土壤非冗余致病菌数据库比对注释致病细菌，得到最终的ASV物种表，通过R语言对ASV物种表中不同样品的致病细菌组成、多样性特征等进行可视化作图。本发明能快速、精准检测致病菌，且不易受到样品污染的影响，可而可实现快速、全面、准确检测致病菌的目标。
主权项：1.一种基于16SrRNA扩增子测序检测土壤致病细菌生物污染的方法，其特征在于包括以下步骤：步骤一、构建土壤非冗余致病细菌数据库；步骤二、完成对土壤植物样品DNA的提取；步骤三、完成样品的16SrRNA基因测序，获得测序下机数据；步骤四、采用DADA2分析流程封装土壤非冗余致病细菌库，获得代表性序列；步骤五、将代表性序列与土壤非冗余致病菌数据库比对注释致病细菌，得到最终的ASV物种表。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 南京农业大学 一种基于16SrRNA扩增子测序检测土壤致病细菌生物污染的方法
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