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申请/专利权人:上海欧易生物医学科技有限公司
摘要:本发明公开了一种适用于Pacbio长读长测序的浒苔DNA的抽提纯化方法。本发明使用CTAB抽提浒苔基因组DNA结合磁珠纯化,所提取的DNA纯度高,OD260280达到1.8‑2.1,OD260230达到2.0‑2.3,所得DNAQubitNanodrop比值在0.5‑2。本发明所提取的DNA片段长度大于50kb,总量达到微克级别,能满足Pacbio三代长读长测序的要求。
主权项:1.一种适用于Pacbio三代长读长测序的DNA提取方法,其特征在于,包括以下步骤:1提取大片段浒苔DNA1将CTAB裂解液和β-巯基乙醇加入离心管中,然后55-70℃预热;2将液氮研磨后的浒苔粉末倒入所述步骤1预热后的离心管中,迅速用手将管内液体摇匀;3向所述步骤2中加入蛋白酶K和RNA酶A,用手将管内液体摇匀,置于55-70℃恒温金属浴中温育30-90分钟;4冷却,然后加入预冷的体积比为25:24:1的酚:氯仿:异戊醇,用手摇匀后置于0-8℃放置1-15分钟;5离心取上清,然后在上清中加入体积比为24:1的氯仿:异戊醇,用手摇匀,置于0-8℃放置1-30分钟;6离心取上清,加入0.5-1倍上清体积的异丙醇,用手将离心管轻柔颠倒混匀,置于-20~-80℃冷冻10分钟-2小时;7离心,用70%的乙醇洗涤沉淀,然后离心,去除上清,得大片段浒苔DNA;待所述浒苔DNA干燥后,用洗脱缓冲液溶解所述浒苔DNA;2稀释DNA并用磁珠纯化DNA8向所述步骤7中浓度低于50ngμl的浒苔DNA中加入0.6×的纯化磁珠,室温静止10分钟;9然后置于磁力架上吸附5分钟,去掉上清,用70%乙醇洗涤10秒,去掉上清,洗涤2次,去掉残余酒精,从磁力架上取下离心管;10用洗脱缓冲液洗脱浒苔DNA,室温静置2分钟后,置于磁力架上吸附5分钟后,吸取上清置于新的离心管中,得到浒苔DNA。
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百度查询: 上海欧易生物医学科技有限公司 一种适用于Pacbio三代长读长测序的高质量浒苔DNA的提取方法
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