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恭喜密歇根大学董事会A·阿林-富伊尔获国家专利权

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龙图腾网恭喜密歇根大学董事会申请的专利用于分析染色质相互作用数据的方法和设备获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN112272849B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-27发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:201980034320.X,技术领域涉及:G16B20/00;该发明授权用于分析染色质相互作用数据的方法和设备是由A·阿林-富伊尔;B·D·阿西;G·A·希金斯;A·阿德设计研发完成,并于2019-03-21向国家知识产权局提交的专利申请。

用于分析染色质相互作用数据的方法和设备在说明书摘要公布了:为了分析染色质的空间组织,计算装置可以使用二叉搜索树将基因组元件触点或读段编译到可变大小的箱中。所述箱可被选择用于各自表示基因组内不同的切割位点增量或功能元件,如基因、TAD、染色质状态片段、环状结构域、染色质结构域等。选择两组箱来生成箱对的正方形基因组矩阵,其中每个组表示所述矩阵的轴。然后将归一化方法应用于具有可变大小和或形状的所述箱对的相互作用频率以生成每个箱对的经归一化的相互作用频率。可以使用所述经归一化的相互作用频率来识别具有富集的触点和贫化的触点的箱对,以进行各种分析,包含基因组变体的靶基因的检测,以及触点的全基因组分析。

本发明授权用于分析染色质相互作用数据的方法和设备在权利要求书中公布了:1.一种用于分析染色质的空间和时间组织的计算机实施的方法,所述方法由被编程为执行所述方法的一个或多个处理器执行,所述方法包括: 在一个或多个处理器处获得基因组元件的一组成对触点; 由所述一个或多个处理器将基因组元件分割成多个箱,其中所述多个箱的箱大小不一致; 由所述一个或多个处理器识别第一组所述多个箱和第二组所述多个箱; 由所述一个或多个处理器生成n×m个箱对的矩阵,其中n对应于所述第一组所述多个箱,并且m对应于所述第二组所述多个箱; 由所述一个或多个处理器识别所述箱对中的每个箱对内的成对触点的子集; 由所述一个或多个处理器确定所述箱对中的每个箱对的相互作用频率; 由所述一个或多个处理器对所述相互作用频率中的每个相互作用频率进行归一化以生成每个箱对的经归一化的相互作用频率;以及 由所述一个或多个处理器提供染色质相互作用的映射以在用户界面上显示,包含对所述箱对的指示和对经归一化的相互作用频率的相应指示,其中对所述相互作用频率中的每个相互作用频率进行归一化包含: 由所述一个或多个处理器确定所述一组成对触点的密度随基因组距离的变化以生成密度函数; 对于所述多个箱对中的每个箱对: 由所述一个或多个处理器对所述箱对的区域上的密度函数进行积分以确定所述箱对的预期密度; 由所述一个或多个处理器通过使用泊松统计分布执行统计分析来将所述箱对内的成对触点的所述子集与所述箱对的所述预期密度进行比较,以确定所述箱对的实际密度大于所述箱对的所述预期密度的量明显显著的似然度; 由所述一个或多个处理器将用于多重比较控制的错误发现率应用于所确定的似然度以确定经过调整的似然度;以及 当经过调整的似然度小于阈值似然度时,由所述一个或多个处理器确定所述箱对具有富集的触点。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人密歇根大学董事会,其通讯地址为:美国密歇根州;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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