恭喜湖南中晟全肽生物科技股份有限公司王宏获国家专利权
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龙图腾网恭喜湖南中晟全肽生物科技股份有限公司申请的专利一种环肽的虚拟解压缩方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117831643B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-20发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202311864121.6,技术领域涉及:G16B50/30;该发明授权一种环肽的虚拟解压缩方法是由王宏;张兴钰;朱宁;王芹芹;王登;王新波;宫焕章;李向群设计研发完成,并于2023-12-29向国家知识产权局提交的专利申请。
本一种环肽的虚拟解压缩方法在说明书摘要公布了:本发明属于生物信息技术领域,尤其涉及一种环肽的虚拟解压缩方法。所述方法将环肽拆解成6~40个氨基酸的多肽分子创建多肽分子库,并对多肽分子库进行虚拟筛选。使用本发明提供的方法能够快速准确的筛选出具有高亲和力的由环肽拆解的多肽分子,极大提高了药物筛选的效率并降低相应成本,为多肽的成药性提供更多可靠的选择,具有广泛的应用前景和研究意义。
本发明授权一种环肽的虚拟解压缩方法在权利要求书中公布了:1.一种具有EGFR抑制活性的80环肽的虚拟解压缩方法,其特征在于,所述80环肽氨基酸序列如SEQIDNo.7所示,所述虚拟解压缩方法包括步骤一和步骤二, 所述步骤一如下: (1)环肽的片段化:基于环肽的结构,将环肽序列进行切割,设定最短长度为6个氨基酸,最长长度为20个氨基酸,切割的间隔为1,得到包含长度为6~20个氨基酸的多肽分子的多肽分子库; (2)多肽分子结构模型预测:使用软件OmegaFold预测切割后的长度为6~15个氨基酸的多肽分子模型结构;使用软件ColabFold预测切割后的长度为16~20个氨基酸序列与靶蛋白的复合物结构模型; (3)多肽分子库的虚拟筛选:所述多肽分子库的虚拟筛选方法选自(a)和(b),其中,方法(a)适用于长度为6~15个氨基酸的多肽分子模型结构,方法(b)适用于长度为16~20个氨基酸的多肽分子模型结构; 所述方法(a)包括: (I)多肽分子模型预处理:步骤(1)(2)完成后以是否含有二硫键的多肽分子模型进行分类; (II)分子对接和分子动力学模拟:选择靶蛋白,使用ADCP软件对多肽分子模型进行分子对接;和使用Amber软件对多肽分子模型进行分子动力学模拟; 所述方法(b)包括: (i)亲和力计算并提取对接后的能量值; (4)结果分析,筛选上述步骤(3)打分前20的多肽分子; 所述步骤二如下: (A)环肽的片段化:基于环肽的结构,将环肽序列进行切割,得到包含长度为6~20个氨基酸的多肽分子的多肽分子库; (B)多肽分子与靶蛋白相互作用计算:使用MM-PBSA软件对多肽分子与靶蛋白相互作用进行计算; (C)结果分析,预测多肽分子中与靶蛋白结合的结合残基。
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