恭喜河南大学宋纯鹏获国家专利权
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龙图腾网恭喜河南大学申请的专利利用麦类作物D基因组外显子捕获测序芯片鉴定节节麦衍生种质片段的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN115449545B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-06-03发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202211137466.7,技术领域涉及:C12Q1/6874;该发明授权利用麦类作物D基因组外显子捕获测序芯片鉴定节节麦衍生种质片段的方法是由宋纯鹏;李浩;周云;刘一帆;朱乐乐;聂芳;范芮晓;李政;李灿;李园园;刘文娟;刘栩沁;李成琳;布梦晨;杨迎盈;朱雨;郭兔兔设计研发完成,并于2022-09-19向国家知识产权局提交的专利申请。
本利用麦类作物D基因组外显子捕获测序芯片鉴定节节麦衍生种质片段的方法在说明书摘要公布了:本发明涉及一种利用麦类作物D基因组外显子捕获测序芯片鉴定节节麦衍生种质片段的方法。包括以下步骤:使用麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片对衍生渐渗系材料、衍生渐渗系材料的双亲进行捕获测序;将衍生渐渗系材料、衍生渐渗系材料的双亲的捕获测序数据比对到小麦参考基因组上,得到衍生渐渗系材料差异位点文件、亲本差异位点文件;对亲本差异位点文件对渐渗系材料差异位点文件进行过滤,保留两个差异位点文件的交集;使用交集文件和亲本差异位点文件统计窗口内衍生渐渗系材料的外源渗入比例;使用渗入比例文件绘制点图,连续高渗入比例的区域界定为外源片段。本发明能准确的用于节节麦衍生的渐渗系或者人工合成材料的外源片段鉴定。
本发明授权利用麦类作物D基因组外显子捕获测序芯片鉴定节节麦衍生种质片段的方法在权利要求书中公布了:1.利用麦类作物D基因组外显子捕获测序芯片鉴定节节麦衍生种质片段的方法,其特征在于,包括以下步骤:步骤一:使用麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片对衍生渐渗系材料的双亲以及衍生渐渗系材料进行捕获测序;衍生渐渗系材料的双亲为小麦亲本P1和节节麦亲本P2;所述麦类D基因组泛基因外显子捕获测序芯片,采用以下方法制备获得:将公开发表的多个节节麦基因组及小麦D亚基因组进行整合,采用迭代法提取基因编码区序列,使用Kmer分类计数分组扩增获得节节麦泛基因组捕获探针;步骤二:将衍生渐渗系材料的小麦亲本P1的捕获测序数据和节节麦亲本P2的捕获测序数据比对到小麦参考基因组上,得到亲本差异位点文件;步骤三:将衍生渐渗系材料的捕获测序数据比对到小麦的参考基因组上,得到衍生渐渗系材料差异位点文件;步骤四:对亲本差异位点文件、对渐渗系材料差异位点文件进行过滤,保留两个差异位点文件的交集,将交集文件作为外源渗入导致的差异位点集合文件;步骤五:使用交集文件和亲本差异位点文件统计窗口内衍生渐渗系材料的外源渗入比例;以亲本差异位点数为分母,交集差异位点数为分子,获得衍生渐渗系材料的渗入比例;步骤六:使用渗入比例文件绘制点图,连续高渗入比例的区域界定为外源片段;其中,将ratio>0.2的渗入比例列为高渗入比例。
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