恭喜安诺优达基因科技(北京)股份有限公司张雪梅获国家专利权
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龙图腾网恭喜安诺优达基因科技(北京)股份有限公司申请的专利对组装的基因组进行优化的方法获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN114496091B 。
龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-30发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202111660340.3,技术领域涉及:G16B30/20;该发明授权对组装的基因组进行优化的方法是由张雪梅;杨伟飞;裴素蕊;李晓波;刘涛;李志民;王娟设计研发完成,并于2021-12-30向国家知识产权局提交的专利申请。
本对组装的基因组进行优化的方法在说明书摘要公布了:本发明提供一种对组装的基因组进行优化的方法,所述方法包括以下步骤:对样本进行测序得到测序序列集;对测序序列集通过两种或两种以上的方式进行组装得到两种或两种以上的初始基因组,并且获得每种初始基因组对应的第一特征和第二特征;遍历每种初始基因组的第一特征,将第一特征占优势的初始基因组作为基础基因组;当除作为基础基因组之外的任一其余初始基因组的第二特征相对于基础基因组的第二特征占优势时,使用所述其余初始基因组的优势区域替换基础基因组的对应区域,以得到优化的基因组。本发明的方法可以使用高完整性的组装序列来纠正低完整性的组装序列,从而获得一个高连续度,高完整度的基因组版本。
本发明授权对组装的基因组进行优化的方法在权利要求书中公布了:1.一种对组装的基因组进行优化的方法,其特征在于,所述方法包括以下步骤:对样本进行测序得到测序序列集;对测序序列集通过两种或两种以上的方式进行组装得到两种或两种以上的初始基因组,并且获得每种初始基因组对应的第一特征和第二特征;遍历每种初始基因组的第一特征,将第一特征占优势的初始基因组作为基础基因组;当除作为基础基因组之外的任一其余初始基因组的第二特征相对于基础基因组的第二特征占优势时,使用所述其余初始基因组的优势区域替换基础基因组的对应区域,以得到优化的基因组;所述第一特征为基因组中拼接获得的序列的长度,所述第二特征表示基因组中组装序列的完整度,所述优势区域是具有优势特征项的区域;使用所述其余初始基因组中的优势区域替换基础基因组中的对应区域包括:对其余初始基因组中的优势区域进行扩展,从其余初始基因组中提取扩展后的区域,并与基础基因组进行序列比对以确认其在基础基因组中的优势扩展区域,并将所述优势扩展区域替换为所述其余初始基因组中的对应区域;所述第一特征为ContigN50,所述第二特征为Busco的C值。
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