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恭喜中国医学科学院肿瘤医院刘芝华获国家专利权

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龙图腾网恭喜中国医学科学院肿瘤医院申请的专利一种获得组织空间转录本信息的方法、装置及电子设备获国家发明授权专利权,本发明授权专利权由国家知识产权局授予,授权公告号为:CN117012278B

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-16发布的发明授权授权公告中获悉:该发明授权的专利申请号/专利号为:202310994114.1,技术领域涉及:G16B25/20;该发明授权一种获得组织空间转录本信息的方法、装置及电子设备是由刘芝华;阴荫;赵丫卉设计研发完成,并于2023-08-08向国家知识产权局提交的专利申请。

一种获得组织空间转录本信息的方法、装置及电子设备在说明书摘要公布了:本发明公开了一种获得组织空间转录本信息的方法、装置及电子设备,涉及生物信息技术领域。本发明提供的方法比现有的空间转录组技术增加了长读长测序步骤并从而增加了剪切本层面的空间信息。极大程度上简化了整个剪切本的鉴定和定量分析,有利于快速获得获得组织空间转录本信息。此外,采用本发明提供的方法获得的长读长测序的转录本数据质量有所提升,能够获得更为完整的转录本,大幅降低了全长转录本信息的丢失。

本发明授权一种获得组织空间转录本信息的方法、装置及电子设备在权利要求书中公布了:1.一种获得组织空间转录本信息的方法,其特征在于,其包括如下步骤:长读长测序:先对空间转录组建库的待测组织的全长cDNA序列进行纯化,然后采用引物对纯化后的全长cDNA序列进行扩增以生成用于制备纳米孔测序文库的材料,采用纳米孔测序文库的试剂盒制备纳米孔测序文库;并对所述纳米孔测序文库进行PCR扩增;牛津纳米孔数据处理:将所述PCR扩增的cDNA与牛津纳米孔试剂盒中的适配器连接,产生嵌合cDNA;然后对嵌合cDNA的内部模板转换寡核苷酸(TSO)、由polyT连接的3'适配器序列进行扫描,然后对所有读段的polyAT尾部和3'适配器序列进行扫描;用生信软件将扫描到的读数对准待测样本的参考基因组,再使用为单细胞文库描述的策略和软件将空间条形码和UMI分配给纳米孔读取;再对每个空间点和基因的SAM记录进行UMI分组;根据UMI的可用读取数使用SPOA计算一致序列;使用TSO末端和polyA序列前的碱基之间的序列;利用生信软件以拼接比对的方式将ConsensuscDNA序列与待测样本的参考基因组的序列进行比对;分析与已知基因匹配的SAM记录,以匹配GencodevM24转录物异构体。

如需购买、转让、实施、许可或投资类似专利技术,可联系本专利的申请人或专利权人中国医学科学院肿瘤医院,其通讯地址为:100021 北京市朝阳区潘家园南里17号;或者联系龙图腾网官方客服,联系龙图腾网可拨打电话0551-65771310或微信搜索“龙图腾网”。

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