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龙图腾网恭喜天津市肿瘤医院空港医院申请的专利一种恶性实体肿瘤的新抗原预测方法及系统获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119446264B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-06发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510034286.3，技术领域涉及：G16B20/50；该发明授权一种恶性实体肿瘤的新抗原预测方法及系统是由郝希山;李晓玲;苏红;洪丽萍设计研发完成，并于2025-01-09向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种恶性实体肿瘤的新抗原预测方法及系统在说明书摘要公布了：本发明涉及肿瘤新生抗原检测技术领域，具体公开了一种恶性实体肿瘤的新抗原预测方法及系统，方法包括：获取肿瘤样本和外周血样本，并进行DNA和RNA测序；经分析处理，得到DNA测序数据和RNA测序数据；分析得到HLA分型结果和突变蛋白的序列；计算得到新抗原相关特征值；计算新抗原得分；截取得分最高的前N个，得到恶性实体肿瘤的新抗原预测结果。本发明从新抗原的作用机制出发，根据预测过程的关键步骤，选择多个特征值，不采用硬性的过滤指标，采用乘积的方式，根据各个新抗原相关特征值的评分，计算新抗原得分。

本发明授权一种恶性实体肿瘤的新抗原预测方法及系统在权利要求书中公布了：1.一种恶性实体肿瘤的新抗原预测方法，其特征在于，包括以下步骤：步骤1：获取肿瘤样本和外周血样本，并进行DNA和RNA测序；步骤2：对DNA测序结果依次进行数据质控、基因组参考序列的比对、UMI检测以及比对数据去重的分析，得到DNA测序数据，对RNA测序结果依次进行数据质控和基因组参考序列的比对，得到RNA测序数据；步骤3：根据DNA测序数据和RNA测序数据，分析得到HLA分型结果和突变蛋白的序列；步骤4：根据HLA分型结果和突变蛋白的序列，计算得到新抗原相关特征值；步骤5：根据新抗原相关特征值，计算新抗原得分；新抗原相关特征值包括Pm、Cm、Sm、Fm、Dm、Dai和PRm，Pm表示突变肽与MHCI结合亲和力在8个以BA为模型的软件中预测Rank值小于2的占比，以及在2个EL为模型的软件中预测Rank值小于等于2的占比之和；8个以BA为模型的软件为SMM、SMMPMBEC、NetMHC-4、NetMHCcons、MHCnuggets、PickPoket、MHCflurryBA和NetMHCpanBA；2个EL为模型的软件为MHCflurryEL和NetMHCpanEL；Cm表示突变肽被蛋白酶剪切的效率；Sm表示突变肽与MHCI类结合的稳定性；Fm表示突变肽与IEDB抗原的相似度；Dm表示突变肽与人类能够作为免疫原或识别抗原的正常蛋白序列之间的差异程度；Dai表示突变肽与MHCI类结合亲力、野生肽与MHCI类结合亲和力的差异指数； 其中，表示野生肽与MHCI类结合亲力的最终的亲和力值，表示突变肽与MHCI类结合亲力的最终的亲和力值；PRm表示突变肽与MHCI类结合复合物被TCR识别的可能性得分的排序百分比；步骤5中，新抗原的打分函数为：Neo_Score=Pm×Cm×Sm×（1+Fm）×Dai×PRm（1+Dm）其中，Neo_Score表示新抗原得分；步骤6：选择新抗原得分最高的N个新抗原，作为恶性实体肿瘤的新抗原预测结果。

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