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龙图腾网恭喜墨卓生物科技(浙江)有限公司申请的专利一种在单细胞微生物基因组中组装基因组序列的方法获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN119694397B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-05-06发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202510221583.9，技术领域涉及：G16B30/20；该发明授权一种在单细胞微生物基因组中组装基因组序列的方法是由巢杉设计研发完成，并于2025-02-27向国家知识产权局提交的专利申请。

本一种在单细胞微生物基因组中组装基因组序列的方法在说明书摘要公布了：本发明提供了一种在单细胞微生物基因组中组装基因组序列的方法。该方法可以1自动计算组装轮数，且全流程仅需要一次任务提交；2控制bin的污染度在较低水平，以便后续分析；3采用分组的方式计算相似度矩阵，减少高SAG数时的内存消耗，提高运算速度；4计算相似度时，仅纳入可靠度较高的contig；且可以根据分析实际情况，动态选择或调整相似度阈值，以便适应不同的样本类型或文库质量。

本发明授权一种在单细胞微生物基因组中组装基因组序列的方法在权利要求书中公布了：1.一种在单细胞微生物基因组中组装基因组序列的方法，其特征在于，包括：S1.获取单细胞微生物基因组测序文库，每个SAG生成一个bin，初始化bin列表；S2.根据当前组装轮所设置的k-mer对每个bin进行组装，并评估每个bin的组装结果的完整度、污染度，获得组装信息；k-mer的长度为K，K的取值范围为21-61且K为奇数；S3.若组装信息满足组装终止条件，则输出当前组装轮每个bin的组装结果，否则执行步骤S4；所述组装终止条件为以下1-2中的任意一种：1完整度大于0.5的bin对应的SAG数占SAG总数的比例大于预设的完整性阈值；2组装轮数大于预设的最大组装轮数；S4.对所有bin进行分组，根据bin两两之间的相似度对小组内bin进行层次聚类；再根据动态调节的相似度阈值将层次聚类结果拆分为一个或多个聚类，直至小组内聚类数目或相似度阈值满足预设的拆分终止条件；将小组内单个聚类中的bin合并成一个新的bin，再将所有小组的新的bin进行汇总，获得下一组装轮的bin列表；S5.若下一组装轮与当前组装轮的bin列表具有相同的bin数目，则输出当前组装轮每个bin的组装结果，否则更新k-mer后再重复执行步骤S2至S4；步骤S4包括：S4-1.对每个bin的组装结果进行过滤，获得每个bin的过滤后组装结果；S4-2.将所有bin划分为多个小组，并根据每个bin的过滤后组装结果以及当前组装轮所设置的k-mer分别计算小组内bin两两之间的相似度；S4-3.根据每个bin的组装结果的完整度、污染度对相似度进行修改，根据修改后的相似度对小组内的bin进行层次聚类，获得小组层次聚类结果；S4-4.根据相似度阈值对小组层次聚类结果拆分为一个或多个聚类，计算小组内所有聚类与所有bin的数目之比R；S4-5.若R小于比例阈值，则执行步骤S4-6；否则下调相似度阈值，若下调后的相似度阈值小于最小相似度，则执行步骤S4-6，否则重复执行步骤S4-4；S4-6.将小组内单个聚类中的bin合并成一个新的bin，再将所有小组的新的bin进行汇总，更新bin列表；步骤S4-1中，对每个bin的组装结果进行过滤的方法包括：除去bin的组装结果中长度小于长度阈值的contig；所述长度阈值为组装结果中ContigN50长度的L分之一；所述L的取值范围为5~20。

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