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龙图腾网恭喜江苏省农业科学院申请的专利一套基于液相芯片和KASP技术开发的水稻核心SNP标记组合及其应用获国家发明授权专利权，本发明授权专利权由国家知识产权局授予，授权公告号为：CN117535387B 。

龙图腾网通过国家知识产权局官网在2025-04-08发布的发明授权授权公告中获悉：该发明授权的专利申请号/专利号为：202311571199.9，技术领域涉及：C12Q1/6858；该发明授权一套基于液相芯片和KASP技术开发的水稻核心SNP标记组合及其应用是由朱小品;徐婷婷;孟珊;颜伟;狄佳春;杨雪;朱银;杨欣;郭春滨设计研发完成，并于2023-11-22向国家知识产权局提交的专利申请。

本一套基于液相芯片和KASP技术开发的水稻核心SNP标记组合及其应用在说明书摘要公布了：本发明公开了一套基于液相芯片和KASP技术开发的水稻核心SNP标记组合及其应用。本发明提供了水稻基因组中60个SNP位点的如下应用：制备水稻SNP位点检测试剂盒；对水稻种质资源或遗传群体进行基因分型；构建水稻种质资源或品种DNA分子指纹数据库；对水稻种质资源进行遗传多样性分析。本发明所提供的60个SNP位点组合，可应用于水稻分子指纹数据库构建、品种鉴定以及种质资源遗传多样性分析；而且这60核心位点组合的应用相比较目前广泛使用的生化检测方法以及SSR方法可极大提高检测准确度、缩短检测时间、提高检测水平。这将为分子检测提供更有效、可靠的技术手段；并将为水稻品种鉴定提供重要的技术支撑。

本发明授权一套基于液相芯片和KASP技术开发的水稻核心SNP标记组合及其应用在权利要求书中公布了：1.用于检测水稻基因组中60个SNP位点的成套KASP引物在如下任一中的应用：（1）制备水稻SNP位点检测试剂盒；（2）对水稻种质资源或遗传群体进行基因分型；（3）构建水稻种质资源或品种DNA分子指纹数据库；（4）对水稻种质资源进行遗传多样性分析；所述60个SNP位点的物理位置是基于水稻品种日本晴的全基因组序列对比确定的，所述水稻品种日本晴的全基因组序列的版本号为MSU7.0；所述60个SNP位点是OsK01-OsK60；Osk1位于1号染色体上第1228512位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk2位于1号染色体上第4645481位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk3位于1号染色体上第6644387位，其脱氧核苷酸为C或A；Osk4位于1号染色体上第9305876位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk5位于1号染色体上第12854426位，其脱氧核苷酸为C或G；Osk6位于1号染色体上第24749480位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk7位于1号染色体上第30545662位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk8位于2号染色体上第5785532位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk9位于2号染色体上第21772969位，其脱氧核苷酸为G或C；Osk10位于2号染色体上第34474061位，其脱氧核苷酸为C或A；Osk11位于2号染色体上第35882696位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk12位于3号染色体上第7956017位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk13位于3号染色体上第13775121位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk14位于3号染色体上第16579520位，其脱氧核苷酸为C或T；Osk15位于3号染色体上第25181277位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk16位于4号染色体上第15846017位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk17位于4号染色体上第19209543位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk18位于4号染色体上第21469290位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk19位于4号染色体上第22842238位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk20位于4号染色体上第31997187位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk21位于5号染色体上第7384864位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk22位于5号染色体上第17035145位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk23位于5号染色体上第23305515位，其脱氧核苷酸为G或C；Osk24位于6号染色体上第1529649位，其脱氧核苷酸为G或T；Osk25位于6号染色体上第3166267位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk26位于6号染色体上第8454606位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk27位于6号染色体上第10345230位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk28位于6号染色体上第25220061位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk29位于7号染色体上第2865195位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk30位于7号染色体上第4660773位，其脱氧核苷酸为T或A；Osk31位于7号染色体上第8809828位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk32位于7号染色体上第10756612位，其脱氧核苷酸为A或T；Osk33位于7号染色体上第12924029位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk34位于7号染色体上第21324970位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk35位于7号染色体上第24622118位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk36位于8号染色体上第1530355位，其脱氧核苷酸为C或T；Osk37位于8号染色体上第2275008位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk38位于8号染色体上第7890733位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk39位于8号染色体上第19466177位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk40位于8号染色体上第24070735位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk41位于9号染色体上第39319位，其脱氧核苷酸为A或T；Osk42位于9号染色体上第10515653位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk43位于9号染色体上第12725653位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk44位于9号染色体上第13665180位，其脱氧核苷酸为T或G；Osk45位于9号染色体上第17753206位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk46位于10号染色体上第369133位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk47位于10号染色体上第2335637位，其脱氧核苷酸为C或T；Osk48位于10号染色体上第3787248位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk49位于10号染色体上第10724291位，其脱氧核苷酸为T或G；Osk50位于10号染色体上第19029893位，其脱氧核苷酸为C或T；Osk51位于11号染色体上第4374875位，其脱氧核苷酸为C或T；Osk52位于11号染色体上第18935157位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk53位于11号染色体上第20525980位，其脱氧核苷酸为T或C；Osk54位于11号染色体上第26085857位，其脱氧核苷酸为G或A；Osk55位于11号染色体上第28010037位，其脱氧核苷酸为T或G；Osk56位于12号染色体上第215397位，其脱氧核苷酸为C或T；Osk57位于12号染色体上第1794727位，其脱氧核苷酸为T或G；Osk58位于12号染色体上第2738115位，其脱氧核苷酸为A或T；Osk59位于12号染色体上第13784750位，其脱氧核苷酸为A或G；Osk60位于12号染色体上第24090217位，其脱氧核苷酸为T或C；所述成套KASP引物为用于检测所述60个SNP位点的KASP引物；每个待测SNP位点对应的KASP引物均分别包括两条正向引物和一条反向引物；其中两条正向引物分别记作正向引物1和正向引物2；所述正向引物1为在特异性引物1的5'末端连接一种荧光标签序列后所得，所述正向引物2为在特异性引物2的5'末端连接另一种荧光标签序列后所得；用于检测Osk01的所述特异性引物1由SEQIDNo.1的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.61的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.121所示核苷酸组成；用于检测Osk02的所述特异性引物1由SEQIDNo.2的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.62的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.122所示核苷酸组成；用于检测Osk03的所述特异性引物1由SEQIDNo.3的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.63的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.123所示核苷酸组成；用于检测Osk04的所述特异性引物1由SEQIDNo.4的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.64的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.124所示核苷酸组成；用于检测Osk05的所述特异性引物1由SEQIDNo.5的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.65的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.125所示核苷酸组成；用于检测Osk06的所述特异性引物1由SEQIDNo.6的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.66的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.126所示核苷酸组成；用于检测Osk07的所述特异性引物1由SEQIDNo.7的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.67的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.127所示核苷酸组成；用于检测Osk08的所述特异性引物1由SEQIDNo.8的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.68的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.128所示核苷酸组成；用于检测Osk09的所述特异性引物1由SEQIDNo.9的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.69的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.129所示核苷酸组成；用于检测Osk10的所述特异性引物1由SEQIDNo.10的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.70的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.130所示核苷酸组成；用于检测Osk11的所述特异性引物1由SEQIDNo.11的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.71的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.131所示核苷酸组成；用于检测Osk12的所述特异性引物1由SEQIDNo.12的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.72的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.132所示核苷酸组成；用于检测Osk13的所述特异性引物1由SEQIDNo.13的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.73的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.133所示核苷酸组成；用于检测Osk14的所述特异性引物1由SEQIDNo.14的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.74的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.134所示核苷酸组成；用于检测Osk15的所述特异性引物1由SEQIDNo.15的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.75的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.135所示核苷酸组成；用于检测Osk16的所述特异性引物1由SEQIDNo.16的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.76的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.136所示核苷酸组成；用于检测Osk17的所述特异性引物1由SEQIDNo.17的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.77的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.137所示核苷酸组成；用于检测Osk18的所述特异性引物1由SEQIDNo.18的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.78的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.138所示核苷酸组成；用于检测Osk19的所述特异性引物1由SEQIDNo.19的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.79的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.139所示核苷酸组成；用于检测Osk20的所述特异性引物1由SEQIDNo.20的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.80的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.140所示核苷酸组成；用于检测Osk21的所述特异性引物1由SEQIDNo.21的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.81的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.141所示核苷酸组成；用于检测Osk22的所述特异性引物1由SEQIDNo.22的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.82的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.142所示核苷酸组成；用于检测Osk23的所述特异性引物1由SEQIDNo.23的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.83的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.143所示核苷酸组成；用于检测Osk24的所述特异性引物1由SEQIDNo.24的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.84的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.144所示核苷酸组成；用于检测Osk25的所述特异性引物1由SEQIDNo.25的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.85的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.145所示核苷酸组成；用于检测Osk26的所述特异性引物1由SEQIDNo.26的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.86的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.146所示核苷酸组成；用于检测Osk27的所述特异性引物1由SEQIDNo.27的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.87的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.147所示核苷酸组成；用于检测Osk28的所述特异性引物1由SEQIDNo.28的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.88的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.148所示核苷酸组成；用于检测Osk29的所述特异性引物1由SEQIDNo.29的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.89的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.149所示核苷酸组成；用于检测Osk30的所述特异性引物1由SEQIDNo.30的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.90的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.150所示核苷酸组成；用于检测Osk31的所述特异性引物1由SEQIDNo.31的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.91的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.151所示核苷酸组成；用于检测Osk32的所述特异性引物1由SEQIDNo.32的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.92的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.152所示核苷酸组成；用于检测Osk33的所述特异性引物1由SEQIDNo.33的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.93的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.153所示核苷酸组成；用于检测Osk34的所述特异性引物1由SEQIDNo.34的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.94的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.154所示核苷酸组成；用于检测Osk35的所述特异性引物1由SEQIDNo.35的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.95的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.155所示核苷酸组成；用于检测Osk36的所述特异性引物1由SEQIDNo.36的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.96的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.156所示核苷酸组成；用于检测Osk37的所述特异性引物1由SEQIDNo.37的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.97的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.157所示核苷酸组成；用于检测Osk38的所述特异性引物1由SEQIDNo.38的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.98的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.158所示核苷酸组成；用于检测Osk39的所述特异性引物1由SEQIDNo.39的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.99的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.159所示核苷酸组成；用于检测Osk40的所述特异性引物1由SEQIDNo.40的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.100的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.160所示核苷酸组成；用于检测Osk41的所述特异性引物1由SEQIDNo.41的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.101的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.161所示核苷酸组成；用于检测Osk42的所述特异性引物1由SEQIDNo.42的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.102的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.162所示核苷酸组成；用于检测Osk43的所述特异性引物1由SEQIDNo.43的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.103的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.163所示核苷酸组成；用于检测Osk44的所述特异性引物1由SEQIDNo.44的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.104的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.164所示核苷酸组成；用于检测Osk45的所述特异性引物1由SEQIDNo.45的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.105的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.165所示核苷酸组成；用于检测Osk46的所述特异性引物1由SEQIDNo.46的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.106的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.166所示核苷酸组成；用于检测Osk47的所述特异性引物1由SEQIDNo.47的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.107的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.167所示核苷酸组成；用于检测Osk48的所述特异性引物1由SEQIDNo.48的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.108的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.168所示核苷酸组成；用于检测Osk49的所述特异性引物1由SEQIDNo.49的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.109的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.169所示核苷酸组成；用于检测Osk50的所述特异性引物1由SEQIDNo.50的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.110的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.170所示核苷酸组成；用于检测Osk51的所述特异性引物1由SEQIDNo.51的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.111的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.171所示核苷酸组成；用于检测Osk52的所述特异性引物1由SEQIDNo.52的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.112的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.172所示核苷酸组成；用于检测Osk53的所述特异性引物1由SEQIDNo.53的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.113的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.173所示核苷酸组成；用于检测Osk54的所述特异性引物1由SEQIDNo.54的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.114的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.174所示核苷酸组成；用于检测Osk55的所述特异性引物1由SEQIDNo.55的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.115的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.175所示核苷酸组成；用于检测Osk56的所述特异性引物1由SEQIDNo.56的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.116的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.176所示核苷酸组成；用于检测Osk57的所述特异性引物1由SEQIDNo.57的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.117的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.177所示核苷酸组成；用于检测Osk58的所述特异性引物1由SEQIDNo.58的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.118的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.178所示核苷酸组成；用于检测Osk59的所述特异性引物1由SEQIDNo.59的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.119的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.179所示核苷酸组成；用于检测Osk60的所述特异性引物1由SEQIDNo.60的第22位及以后核苷酸组成，所述特异性引物2由SEQIDNo.120的第22位及以后核苷酸组成，所述反向引物由SEQIDNo.180所示核苷酸组成。

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