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高粱DNA指纹图谱、构建方法及应用 

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摘要:本发明属于分子生物学技术领域,具体涉及高粱DNA指纹图谱、构建方法及在高粱种质资源快速鉴定上的应用。针对现有技术中还未见采用DNA指纹图谱对高粱品种及来源鉴定的方法,本发明提供一种高粱DNA指纹图谱,构建方法及其在精准鉴定高粱种源上的应用。本发明通过筛选得到的20个微核心SNP位点信息,能快速高效地追溯高粱种类及来源。所构建的DNA指纹图谱能用于高粱种质资源分类鉴定以及育种改良等方面,不仅提供了专属于不同用途高粱品种及其近缘种的全新身份信息,还可以精准鉴定个体真实性。其在高粱种质资源分类、品种鉴定、追溯个体来源等方面具有良好的应用前景。

主权项:1.高粱DNA指纹图谱在鉴定高粱品种和来源上的应用,其特征在于:是采用特定引物扩增待测高粱基因组DNA中的20个微核心SNP位点作为目标序列,再将目标序列与所构建的高粱DNA指纹图谱上的序列进行比对,从而鉴定出高粱品种和来源;其中,所述高粱DNA指纹图谱是通过以下20个微核心SNP位点建立的: 位点号 染色体位置 变异类型 第1位点 其位于1号染色体第1199231bp处 变异类型为TC 第2位点 其位于1号染色体第67232638bp处 变异类型为TG 第3位点 其位于2号染色体第4500196bp处 变异类型为TG 第4位点 其位于2号染色体第63471876bp处 变异类型为AT 第5位点 其位于3号染色体第5944390bp处 变异类型为GA 第6位点 其位于3号染色体第53164324bp处 变异类型为CT 第7位点 其位于4号染色体第11091330bp处 变异类型为CA 第8位点 其位于4号染色体第57348837bp处 变异类型为TA 第9位点 其位于5号染色体第3699724bp处 变异类型为AT 第10位点 其位于5号染色体第69449675bp处 变异类型为CT 第11位点 其位于6号染色体第3322165bp处 变异类型为GT 第12位点 其位于6号染色体第51881035bp处 变异类型为AT 第13位点 其位于7号染色体第960712bp处 变异类型为TG 第14位点 其位于7号染色体第61360608bp处 变异类型为AG 第15位点 其位于8号染色体第1966649bp处 变异类型为AC 第16位点 其位于8号染色体第61076580bp处 变异类型为CT 第17位点 其位于9号染色体第2300487bp处 变异类型为CG 第18位点 其位于9号染色体第40568275bp处 变异类型为TG 第19位点 其位于10号染色体第7589533bp处 变异类型为GC 第20位点 其位于10号染色体第56000939bp处 变异类型为TC 所述特定引物是对所述的20个微核心SNP位点设计的对应引物,如下所示:

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百度查询: 四川农业大学 高粱DNA指纹图谱、构建方法及应用

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