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一种大肠杆菌利用甲醇和D-木糖发酵生产D-阿洛酮糖的方法 

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摘要:本发明提供一种大肠杆菌利用甲醇和D‑木糖发酵生产D‑阿洛酮糖的方法,利用大肠杆菌为宿主细胞,通过在野生大肠杆菌中表达外源基因甲醇脱氢酶Mdh、3‑己糖‑6‑磷酸合成酶Hps、6‑磷酸‑3‑己糖异构酶Phi、D‑阿洛酮糖‑6‑磷酸差向异构酶AlsE、D‑阿洛酮糖‑6‑磷酸磷酸酶A6PP,建立一条从甲醇和D‑木糖到合成D‑阿洛酮糖的路径。为提高AlsE蛋白的表达量引入蛋白标签SUMO。通过敲除副产物途径基因frmABR,磷酸戊糖途径的关键基因rpiA,以及糖酵解途径的关键基因pfkA,pfkB,得到一株重组菌株,实现碳源的理性控制,从而实现大肠杆菌利用甲醇和D‑木糖高效合成D‑阿洛酮糖。

主权项:1.一种大肠杆菌利用甲醇和D-木糖发酵生产D-阿洛酮糖的方法,其特征在于,通过引入外源基因mdh、hps、phi、alsE、a6PP,建立以甲醇和D-木糖为碳源制备D-阿洛酮糖的合成路径,通过敲除副产物途径基因frmABR、磷酸戊糖途径的关键基因rpiA、以及糖酵解途径的关键基因pfkA、pfkB,最终得到D-阿洛酮糖高效合成的重组菌株;所述的大肠杆菌利用甲醇和D-木糖发酵生产D-阿洛酮糖的方法,具体包括以下步骤:1)通过构建重组载体,在野生型大肠杆菌JM109DE3中表达外源蛋白Mdh、Hps、Phi、AlsE、A6PP,得到重组菌株E.coli-MdhHpsPhiAlsEA6PP,建立以甲醇和D-木糖为碳源合成D-阿洛酮糖的细胞工厂;2)利用SUMO标签,融合表达AlsE-SUMO蛋白,增强AlsE蛋白在大肠杆菌中的表达量,在野生型大肠杆菌中分别表达外源蛋白AlsE、A6PP和外源蛋白AlsE-SUMO、A6PP,得到重组菌株E.coli-AlsEA6PP和重组菌株E.coli-SUMO-AlsEA6PP;进一步借助胞外酶催化实验,确定添加SUMO标签对AlsE蛋白在大肠杆菌中高效表达的有效作用;3)敲除副产物途径基因frmABR、磷酸戊糖途径的关键基因rpiA以及糖酵解途径的关键基因pfkA、pfkB,得到重组菌株E.coli-MdhHpsPhiAlsEA6PPΔFrmABRΔRpiAΔPfkAΔPfkB,进而实现D-阿洛酮糖的高效合成;其中,frmABR的GeneID为944988、944991、944986,rpiA的GeneID为947407,pfkA的GeneID为948412,pfkB的GeneID为946230;步骤1)中在大肠杆菌JM109DE3中表达的外源基因mdh、hps、phi,其中mdh基因来自钩虫菌,hps基因来自甲醇芽孢杆菌,phi基因来自荚膜甲基球菌,基因序列参照NCBI数据库,mdh、hps、phi基因的NCBI序列号分别为WP_013953014.1、WP_014707664、WP_064496767,alsE基因来自大肠杆菌K-12菌株,a6PP基因来自脆弱拟杆菌,基因序列参照NCBI数据库,alsE和a6PP基因的NCBI序列号分别为S101520_02794和BF9343_0892。

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