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基于CRISPR/Cas12a和逻辑门的甲流和乙流信号分析系统 

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摘要:本发明是一种基于CRISPRCas12a和逻辑门的甲流和乙流信号分析系统。本发明将CRISPRCas12a系统与SDA等温扩增和逻辑门耦联,成功实现了甲流和乙流病毒的逻辑识别。BstNI精确切割可以实现病毒RNA的转化,拓宽了靶标检测范围。SDA等温核酸扩增可提供高效的扩增,无需复杂的温度循环设备,可实现靶标信号的放大。CRISPRCas12a具有高度特异性识别能力,可以增强对靶标的识别,其模块化特性增加了与其他分子网络衔接的能力。逻辑门实现了对甲流和乙流的逻辑信号分析。同时,我们提出的这种检测策略,只需要改变转换子和扩增的模板,就可以实现其他核酸的检测。结果表明,该逻辑门生物传感器在疾病诊断方面具有潜在的应用价值。

主权项:1.一种基于CRISPRCas12a和逻辑门的甲流和乙流信号分析系统,其制备方法包括以下步骤:1甲流和乙流RNA序列转化初始阶段涉及BstNI精确切割RNADNA异源双链体中的DNA,以将甲流或乙流RNA转化为短DNA;将8ul的甲型乙型流感病毒RNA、8ul10uM的甲型乙型流感病毒DNA转化子于37摄氏度孵育10分钟;接着加入1.5ul10×的NEBuffer3.1、1.7ul10Uul的BstNI和0.8ul的焦碳酸二乙酯DEPC处理水在55摄氏度反应10分钟,即可得到转化的启动子AB;将以上转化的启动子AB置于4摄氏度储存;2输入链的制备利用制备的启动子用于链置换等温扩增SDA产生下游逻辑门的输入链;将10ul的转化产物、1ul10uM的模板AB、1ul10×的BstDNAPolymerase、1ul10×的ThermoPol、1ul10×的Nt.BstNBI、1ul10×的NEBufferr3.1、1ul10mM的dNTP和4ul的纯净水混合,在55摄氏度反应30分钟后在80摄氏度反应15min终止反应,即可得到输入链InputAB;3逻辑门的制备1.2ul10uM的crRNA、1ul10uM的Cas和22.8的DEPC水混合制备400n的crRNA-Cas复合物;AND逻辑门门控体系中包含2ul400nM的crRNA-Cas复合物、2ul10×的Cutsmart缓冲液、1ul5uM的HEX报告基因、2ul10mM的DTT溶液和3ul的DEPC水;400nM的crRNA-Cas复合物、1uM的OR-pre-exsited-R以体积比2:1孵育10min制备预复合物1;400nM的crRNA-Cas复合物、1uM的OR-pre-exsited-L以体积比2:1孵育10min制备预复合物2;OR逻辑门门控体系中包含1ul预复合物1、1ul预复合物2、2ul10×的Cutsmart缓冲液、1ul5uM的HEX报告基因、2ul10mM的DTT溶液和3ul的DEPC水;800nM的crRNA-Cas复合物、1uM的NOR-pre-exsited-L1、1uM的NOR-pre-exsited-R1以体积比2:1:1孵育10min制备预复合物3;800nM的crRNA-Cas复合物、1uM的NOR-pre-exsited-L2、1uM的NOR-pre-exsited-R2以体积比2:1:1孵育10min制备预复合物4;NOR逻辑门门控体系中包含1ul预复合物3、1ul预复合物4、2ul10×的Cutsmart缓冲液、1ul5uM的HEX报告基因、2ul10mM的DTT溶液和3ul的DEPC水;这样就建立起基于逻辑门的甲流和乙流信号分析系统;4信号输出将10ul的InputAB与制备好的10ul的AND、OR、NOR逻辑门门控体系溶液混合,于ROTOR荧光仪在37摄氏度反应1小时,在HEX通道测荧光信号,即可对甲流和乙流进行逻辑信号分析。

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百度查询: 重庆医科大学国际体外诊断研究院 基于CRISPR/Cas12a和逻辑门的甲流和乙流信号分析系统

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