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一种高效建立大豆DNA指纹图谱的方法 

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摘要:本发明提供一种高效建立大豆DNA指纹图谱的方法,包括以下步骤:S1.收集大豆品种的重测序数据;S2.使用种群分化系数FST对大豆SNP进行全基因组扫描分析,以鉴定基因组中的分化区域,从而分析野生和栽培大豆群体之间的遗传差异;S3.根据等位基因频率的差异筛选多态性SNP,将SNP分为两类,第一类用于野生大豆的指纹图谱设计,第二类用于栽培大豆的指纹图谱设计;S4.利用等位基因特异性聚合酶链反应ARMS‑PCR技术设计引物,并使用设计的引物针对所筛选的SNP进行PCR反应测试;S5.利用通过ARMS‑PCR验证的SNP标记构建不同品种的指纹图谱。利用本发明得到的高效SNP标记可以有效快速的对大豆品种进行区分,有助于大豆的种质资源的鉴定和保存。

主权项:1.一种高效建立大豆DNA指纹图谱的方法,其特征在于,包括以下步骤:S1.收集大豆品种的重测序数据;S2.使用种群分化系数FST对大豆SNP进行全基因组扫描分析,以鉴定基因组中的分化区域,从而分析野生和栽培大豆群体之间的遗传差异;S3.根据等位基因频率的差异筛选多态性SNP,将SNP分为两类,第一类用于野生大豆的指纹图谱设计,第二类用于栽培大豆的指纹图谱设计;S4.利用等位基因特异性聚合酶链反应ARMS-PCR技术设计引物,并使用设计的引物针对所筛选的SNP进行PCR反应测试;S5.利用通过ARMS-PCR验证的SNP标记构建不同品种的指纹图谱。

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权利要求:

百度查询: 香港中文大学深圳研究院 一种高效建立大豆DNA指纹图谱的方法

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