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一种鉴定长链非编码RNA相互作用RNA分子的方法 

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摘要:本发明公开了一种鉴定长链非编码RNA相互作用RNA分子的方法,涉及生物技术领域。本发明的鉴定长链非编码RNA相互作用RNA分子的方法具有以下优点:1与现有技术中的lncRNA相互作用RNA分子鉴定方法相比,本发明的sarID不依赖于交联和免疫沉淀,避免了交联和免疫沉淀带来的假阳性率高、特异性和分辨率较低的问题。2本发明的鉴定长链非编码RNA相互作用RNA分子的方法可用于在活细胞中鉴定特定lncRNA分子的互作RNA分子;3本发明的鉴定长链非编码RNA相互作用RNA分子的方法简化了实验流程,能够节约时间、降低成本;4本发明的鉴定长链非编码RNA相互作用RNA分子的方法可推广使用于鉴定其他类型RNA的互作RNA分子,应用广泛。

主权项:1.一种鉴定长链非编码RNA相互作用RNA分子的方法,其特征在于,包括以下步骤:1设计靶向目标lncRNA的sgRNA;2分别构建表达dPSPS蛋白、MCP-APOBEC1融合蛋白的慢病毒载体;3将表达sgRNA、表达dPSPS蛋白以及表达MCP-APOBEC1融合蛋白的慢病毒感染靶细胞,并对靶细胞进行筛选,构建稳定表达细胞株;4对所述稳定表达细胞株进行诱导培养,并提取细胞RNA;5对步骤4的RNA进行测序分析鉴定具有C到U突变位点的RNA,确定所述目标lncRNA相互作用RNA。

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