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摘要：本发明公开了一种基于网络药理学及分子对接分析化合物治疗乳腺癌作用机制的方法，包括步骤：S1：药物‑疾病共同靶点获取；S2：蛋白质相互PPI网络构建；S3：核心靶点的获取；S4：KEGG通路富集分析和GO功能富集分析探索其具体机制；S5：分子对接进一步对其机制进行探索。本发明方法简化了网络药理学的入学门槛，使用的方法为直接在各个数据库挖掘数据，且将网络药理学与分子对接结合，使内容更有层次，能够准确分析化合物治疗乳腺癌的作用机制。

主权项：1.一种基于网络药理学及分子对接分析化合物治疗乳腺癌作用机制的方法，包括如下步骤：S1：药物-疾病共同靶点获取PubChem数据库获得化合物的2D或3D结构，并且预测化合物的作用靶点，再在SwissTargetPrediction数据库中用所述化合物的2D结构进行检索，以Probability＞0进行筛选，再次获取化合物的作用靶点；利用Uniprot数据库将获取的化合物作用靶点根据基因名寻找对应的UniprotID；在GeneCards数据库以“Breastcancer”为关键词进行检索，预测乳腺癌的作用靶点，以Score≥5进行筛选；利用上述方法获得的乳腺癌和药物靶点，通过DrawVennDiagram绘制韦恩图，得到化合物干预乳腺癌的潜在靶点；S2：蛋白质相互PPI网络构建将获取的化合物-乳腺癌共同靶点导入STRING数据库建立PPI网络，将蛋白质分类设为“Homosapiens”，交互分数0.4，PPI网络其它参数为默认设置，去除游离靶点，建立PPI网络图，获取的PPI网络关系表；S3：核心靶点的获取将获取的PPI网络关系表导入Cytoscape3.9.1，创建化合物干预乳腺癌潜在靶点的PPI网络关系，并且使用cytoHubba插件分别计算出Betweenness、Closeness、Degree值，筛选出核心靶点；S4：KEGG通路富集分析和GO功能富集分析探索其具体机制利用Metascape数据库对化合物在乳腺癌中发挥作用的潜在靶点进行KEGG通路富集分析和GO功能富集分析，从Metascape数据库获取的KEGG通路富集分析和GO功能富集分析根据-log10P排序，通过KEGG通路富集分析和GO功能富集分析得出化合物作用于乳腺癌的潜在机制；S5：分子对接进一步对其机制进行探索由KEGG通路富集分析得出与化合物对乳腺癌的作用机制密切相关的信号通路，根据S3得到的化合物作用于乳腺癌的核心靶点，对化合物和核心靶点进行分子对接，由此得出此核心靶点在化合物作用于乳腺癌中发挥至关重要的作用。

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百度查询： 重庆医科大学 一种基于网络药理学及分子对接分析化合物治疗乳腺癌作用机制的方法