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摘要：本发明公开了一种具有抗肿瘤药效的STAT3抑制剂的虚拟筛选方法及应用。虚拟筛选方法包括：STAT3蛋白晶体结构的选择与预处理：从ProteinDataBank数据库中获取STAT3蛋白‑小分子复合物晶体结构，对STAT3蛋白‑小分子复合物晶体结构进行预处理；生成对接盒子：选择对接盒子中心并设置对接盒子尺寸；选择并下载待筛选化合物库；化合物虚拟筛选工作流：以虚拟筛选工作流模式依次经过化合物库预处理、多模式分子对接、MMGBSA计算重新打分排序获得结合自由能为负且绝对值从大到小排序靠前的化合物；分子动力学模拟筛选活性分子：采用BindingPoseMetadynamics的分子动力学模拟方法筛选获得具有潜在活性的化合物。
主权项：1.一种具有抗肿瘤药效的STAT3抑制剂的虚拟筛选方法，其特征在于，包括步骤：1STAT3蛋白晶体结构的选择与预处理：从ProteinDataBank数据库中获取STAT3蛋白-小分子复合物晶体结构，对STAT3蛋白-小分子复合物晶体结构进行预处理；2生成对接盒子：选择对接盒子中心并设置对接盒子尺寸；3选择并下载待筛选化合物库；4化合物虚拟筛选工作流：以虚拟筛选工作流模式依次经过化合物库预处理、多模式分子对接、MMGBSA计算重新打分排序获得结合自由能打分靠前的化合物；所述结合自由能打分靠前是指结合自由能为负且绝对值从大到小排序靠前；5分子动力学模拟进一步筛选活性分子：采用BindingPoseMetadynamics的分子动力学模拟方法进一步筛选获得具有潜在活性的化合物。
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百度查询： 东海实验室 具有抗肿瘤药效的STAT3抑制剂的虚拟筛选方法及应用
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