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摘要:本发明提出了一种结肠腺癌合并多发腺瘤性息肉患者的预后模型及其构建方法,包括:收集结肠腺癌临床样本和多发腺瘤性息肉临床样本,并分别进行代谢组学检测,获得代谢产物,以及对代谢产物进行差异分析,筛选出显著差异性代谢物;对临床样本进行蛋白质组学分析,筛选出显著差异蛋白质;对显著差异性代谢物和显著差异蛋白质进行联合分析后,基于TCGA‑COAD数据库和GTEx数据库筛选出差异基因,将显著差异蛋白经Uniprot数据库转换为对应差异基因名称,并将显著差异蛋白基因与差异基因进行联合分析,获得共表达基因;利用共表达基因进行单因素Cox比例风险回归分析,识别出预后基因;根据计算出的预后基因的多因素系数,构建预后模型。本发明更加贴合临床,便于临床医生高效经济使用。
主权项:1.一种结肠腺癌合并多发腺瘤性息肉患者的预后模型构建方法,其特征在于,包括以下步骤:S1、收集结肠腺癌临床样本和多发腺瘤性息肉临床样本,并分别进行代谢组学检测,获得代谢产物,以及对所述代谢产物进行差异分析,根据设定第一阈值筛选出显著差异性代谢物;S2、对所述结肠腺癌临床样本和多发腺瘤性息肉临床样本进行蛋白质组学分析,根据设定第二阈值筛选出显著差异蛋白质;S3、对所述显著差异性代谢物和所述显著差异蛋白质进行联合分析后,基于TCGA-COAD数据库和GTEx数据库筛选出差异基因,将所述显著差异蛋白质转换为差异蛋白基因,并将所述差异蛋白基因与所述差异基因进行联合分析,获得共表达基因;S4、利用所述共表达基因进行单因素Cox比例风险回归分析,识别出预后基因;S5、根据计算出的所述预后基因的多因素系数,构建预后模型。
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百度查询: 复旦大学附属中山医院厦门医院 一种结肠腺癌合并多发腺瘤性息肉患者的预后模型及其构建方法
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