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摘要:本发明涉及一种云上黑山羊40K液相芯片及其应用,所述芯片中含有用于探测204个前景SNP位点的探针,所述204个前景SNP位点为与繁殖、生长、乳房发育、乳品质、毛色及云上黑山羊基因身份证相关的功能SNP位点;所述芯片中还含有用于探测35000‑45000个背景SNP位点的探针,所述背景SNP位点的选取原则为:基于云上黑山羊全基因组测序数据选取的氨基酸或者起始、终止密码子发生变化的SNP位点和全基因组均匀覆盖SNP位点,参考基因组的版本号为ARS1。本发明提供的云上黑山羊40K液相芯片应用在云上黑山羊基因型检测、全基因组关联分析、品种鉴定、亲缘关系分析、云上黑山羊新品系培育中,可以有效提高云上黑山羊精准育种水平。
主权项:1.一种云上黑山羊40K液相芯片,其特征在于,所述芯片中含有用于探测204个前景SNP位点的探针,所述204个前景SNP位点为与繁殖、生长、乳房发育、乳品质、毛色及云上黑山羊基因身份证相关的功能SNP位点,所述204个前景SNP位点信息如下表所示: 所述芯片中还含有用于探测35000-45000个背景SNP位点的探针,所述背景SNP位点的选取原则为:基于云上黑山羊全基因组测序数据选取的氨基酸或者起始、终止密码子发生变化的SNP位点和全基因组均匀覆盖SNP位点,参考基因组的版本号为ARS1。
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百度查询: 云南省畜牧兽医科学院 一种云上黑山羊40K液相芯片及其应用
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