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摘要：本发明涉及基因组数据分析技术领域，尤其涉及一种全基因DNA数据再定义方法。包括：获取待测物种的基因组区域文件、参考基因组文件和基因组变异位点文件；基因组变异位点文件通过比对参考基因组文件确定；在基因组区域文件中提取待测物种的基因所在位置的数据信息；通过基因组变异位点文件确定突变位点；对基因组区域文件中的数据信息进行分类；以基因编码区为权重，其他区域按照在所述待测物种的生物过程中发挥的作用和距离所述突变位点的距离由高到低依次打分，距离所述突变位点最近的位置信息的区域记为10分，其他区域内依次递减打分；根据得分对所述待测物种进行定义。优点在于：计算简单、节约时间、应用广泛。
主权项：1.一种全基因DNA数据再定义方法，其特征在于，具体包括如下步骤：S1.获取文件：获取待测物种的基因组区域文件、参考基因组文件和基因组变异位点文件；所述基因组变异位点文件通过比对所述参考基因组文件确定；所述基因组区域文件包括基因组结构注释文件和蛋白注释文件；S2.数据信息处理：在所述基因组区域文件中提取所述待测物种的基因所在位置的数据信息；通过所述基因组变异位点文件确定突变位点；S3.数据信息分类：对所述基因组区域文件中的数据信息进行分类；S4.打分排序：以基因编码区为权重，对于mRNA、gene、exon、UTR、QTL和或甲基化区域按照在所述待测物种的生物过程中发挥的作用和与突变位点的距离由高到低依次打分后得到区域基础分，再根据每个基因在蛋白互作网络中的节点数计算节点分，每个节点记为1分；打分公式为：节点分=；距离突变位点最近的位置信息的区域记为10分，在距离突变位点的上游和下游1000bp内依次递减打分；将区域基础分与节点分相加，得到得分；根据得分对所述待测物种进行定义。
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百度查询： 海南大学三亚南繁研究院 海南大学三亚研究院 一种全基因DNA数据再定义方法
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