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摘要：本发明公开了一种用于矮脚鸡品种鉴定的SNP位点组合、引物组合和方法，SNP位点组合包括AJ1位点到AJ6位点。采用本发明提供的SNP位点组合进行矮脚鸡品种鉴定时，全部6个SNP位点联合基因型判定为矮脚鸡的概率为100％，只要有一个SNP位点基因型不符合矮脚鸡相应的基因型，即可完全排除该个体属于矮脚鸡。这种方法操作简便，准确性高，可以有效打击市场假冒矮脚鸡产品的行为。

主权项：1.矮脚鸡品种的鉴定方法，其特征在于，包括如下步骤：（1）提取待测鸡基因组总DNA；（2）根据SNP位点组合，利用对应的引物组合分别进行PCR扩增；所述SNP位点组合包括以下AJ1位点到AJ6位点：AJ1位于核苷酸序列GCTTTCACATGACCAGCAGAGAATACGATTTACATGGTGGATCTGACCAACAGTGTAGCCACCTTTGAGTCCTTTGCAGCTGAATACTGTCCAAAACCAGGAACAGAATGAGAAGATCTAGCCAAKAGCTCAGAAACAAACACAGATTTCATGGGCAAGTAGTTGTCTTTTTTTTAAGGGGGGAGGTGGGTTGAAGAAAGTGTGGAATTCTTTATGCTGACTGATGTCAAGATTGCTTTTGTAGCACTGCCA的第126位，其为A或G多态；AJ2位于核苷酸序列GACTTGACCAAAATCGCATGTGGGCAACTGGGTGGCAGCACCGTACTTGGAAAACAGGTCTGGTGAGAKTCGTCATGTGCTGAGAAGGAACCCCAACTCTATCAGCAATAAGCCTTTAACTCCCATGGGTTCACCCCATCCAGCCTCAGGGCTCAGTGAGCTCCCAGGCAGTACTGTACTACAGTGCAACACACTGGGCACACAACCCAGTGCAGCAGACAAGCAACAT的第69位，其为T或C多态；AJ3位于核苷酸序列CAGACCTCCAAGCCTGAATCTGTGTACCACCCATCAGACTATCAGCCTTAGTTAATAAAACACCAGTTACTTTTGTAATTCTTGACACAAACATTCAGCAAATCAAAACAGATCTGCCTGCAGACCTATGAAAACAACACTAGGCTAGCAACKGAGTCCTTTTCAGAAACTATTCTCCCTTTCAATTTTGCACTTGTGGATTGCCTA的第153位，其为G或A多态；AJ4位于核苷酸序列CCAGAAACAGGCATAAACCATTCATAAGAGCTGAAAGAGTTTAGCCTGATTTTCAGTACATGGCTACTGCACACATGTTCAAGTTTCATGTGGTTCACTCTCTCCCTGCCCAGGTGTACAGGGAGAAGAAAGGGGAGAAAAAGGCTTCTTCCCAAGGTGAAGGACACAAAAAKGAGTGAATTGAATCCAACTGTCAGCCCCAGCCTGCTGAACTTCACCATTTGCACTGAACACCTTCTGC的第173位，其为G或A多态；AJ5位于核苷酸序列CGCTCCAAGCAAACAAAAGTCTCTCCCAGTTCACCCTTTTATGATCCTACAGATGCTATTAACAGATCAGCCTAAGGAACAGCAAATATTTGGTGAATCTTCAGGAGCATCAAGGAACTCACTGACCKGACATGGTAAATCTATGCAAATGAATCCCCAGAAAGAAACG的第128位，其为G或A多态；AJ6位于核苷酸序列CCAAGGCCAATTTAGGTTGAGGCATAAACTATCTGTACTGAGAGTTTAAAGGATTGAATCTATCGCTCTCTACACAGCATTGTAGGAGTAGATATTTACAATAAGAACTCAGTGACTTATTTATACTTGAACCAAAGTACTGAGTCCTACTTCTCATGGAAGCTTTGTAAKGACTTAAAATAACCTGGACTACTGAATGAATTATCCCCGAAGTT的171位，其为G或A多态；（3）将PCR扩增产物测序后、判断基因型；（4）如果SNP位点组合对应的基因型有一个不符合矮脚鸡对应的基因型，则判定个体不属于矮脚鸡；如果6个SNP位点组合对应的基因型全部符合矮脚鸡的基因型，则判定个体属于矮脚鸡，6个SNP位点AJ1~AJ6的基因型依次为GG、CC、GG、GG、GG、GG。

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百度查询： 江苏省家禽科学研究所 和盛食品集团有限公司 用于矮脚鸡品种鉴定的SNP位点组合、引物组合和方法