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摘要:本发明公开了一种多部位慢性疼痛潜在治疗靶点确定系统,所述系统包括数据获取模块、可干预基因靶点确认模块、可干预蛋白质靶点确认模块以及MCP潜在治疗靶点确认模块;数据获取模块获取第一GWAS数据、全血的基因表达数据和脑组织的基因表达数据、血蛋白表达数据以及脑蛋白表达数据后,可干预基因靶点确认模块和可干预蛋白质靶点确认模块分别根据获取到的数据确定与MCP相关的可干预基因靶点以及可干预蛋白质靶点,生成可干预基因靶点集和可干预蛋白质靶点集;最后通过MCP潜在治疗靶点确认模块取可干预基因靶点集和蛋白质靶点集的交集内的各靶点作为MCP潜在治疗靶点。通过实施本发明,可以更精准地识别与MCP相关的治疗靶点。
主权项:1.一种多部位慢性疼痛潜在治疗靶点确定系统,其特征在于,包括:数据获取模块、可干预基因靶点确认模块、可干预蛋白质靶点确认模块、MCP潜在治疗靶点确认模块以及蛋白质网络构建及分析模块;所述数据获取模块,用于获取第一GWAS数据、GTExV8数据集中全血的基因表达数据和脑组织的基因表达数据、deCODE数据集中的血蛋白表达数据以及NIAGADS数据集中的脑蛋白表达数据;其中,所述第一GWAS数据为与MCP相关的GWAS数据;所述可干预基因靶点确认模块,用于根据所述全血的基因表达数据、所述脑组织的基因表达数据以及所述第一GWAS数据中相应的遗传变异数据,进行全转录组关联分析,得到所述全血的基因表达数据以及所述脑组织的基因表达数据的P值以及第一效应值方向;将所述全血的基因表达数据以及所述脑组织的基因表达数据的P值进行FDR校正,得到校正P值小于预设FDR校正阈值的第一候选基因表达数据;将所述全血的基因表达数据以及所述脑组织的基因表达数据进行SMRHEIDI分析,得到每一所述全血的基因表达数据以及每一所述脑组织的基因表达数据对应的p-SMR值、p-HEIDI值和第二效应值方向;对每一基因表达数据的p-SMR值进行FDR校正,得到校正p-SMR值小于预设FDR校正阈值的候选基因表达数据后,筛选出所述校正p-SMR值小于预设FDR校正阈值的候选基因表达数据中,p-HEIDI值大于预设值且所述第一效应值方向与所述第二效应值方向一致的第二候选基因表达数据;取所述第一候选基因表达数据与所述第二候选基因表达数据的交集部分,将所述交集部分的基因表达数据作为与MCP相关的可干预基因靶点,生成可干预基因靶点集;所述可干预蛋白质靶点确认模块,用于根据所述第一GWAS数据、所述血蛋白表达数据以及所述脑蛋白表达数据,确定与MCP相关的若干可干预蛋白质靶点,生成可干预蛋白质靶点集;其中,所述根据所述第一GWAS数据、所述血蛋白表达数据以及所述脑蛋白表达数据,确定与MCP相关的若干可干预蛋白质靶点,包括:将所述deCODE数据集中的血蛋白表达数据以及所述NIAGADS数据集中的脑蛋白表达数据作为两样本孟德尔随机化的暴露数据、将所述第一GWAS数据作为两样本孟德尔随机化的结果数据,进行两样本孟德尔随机化,得到所述血蛋白表达数据以及所述脑蛋白表达数据对应的第三效应值方向以及P值;将所述血蛋白表达数据以及所述脑蛋白表达数据的P值进行FDR校正,得到校正P值小于FDR校正阈值的MR阳性蛋白质;将所述MR阳性蛋白质进行贝叶斯共定位分析,将后验结果概率大于预设值的MR阳性蛋白作为与MCP相关的可干预蛋白靶点;所述MCP潜在治疗靶点确认模块,用于确定所述可干预基因靶点集与可干预蛋白质靶点集的交集,将所确定的交集内的各靶点均作为MCP潜在治疗靶点;所述蛋白质网络构建及分析模块包括蛋白质网络构建单元以及蛋白质网络分析单元;所述蛋白质网络构建单元,用于将所述可干预蛋白质靶点输入至一用以构建蛋白质相互作用网络的工具,以使所述工具根据所输入的数据构建一网络;所述蛋白质网络分析单元,用于根据所构建的网络,分析得到所述可干预蛋白质靶点参与的通路和生物过程,以及与所述可干预蛋白质靶点进行相互作用的蛋白;其中,所述参与的通路和生物过程包括:突触蛋白定位、细胞连接的蛋白定位、轴突输送、突触前蛋白定位、轴突-树突输送以及细胞骨架依赖的细胞内运输。
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