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摘要：本发明提供了一种基于基因组分析的水稻种值评估方法以及采用该水稻种值评估方法的水稻育种方法；本发明的水稻种值评估方法根据QTN的功能、农艺性状类别和每一个育种群体样本的QTN基因型，分别统计各农艺性状类别对应的纯合有利QTN基因型数量、纯合不利QTN基因型数量和杂合型QTN基因型数量，并计算每一个育种群体样本的育种值评估分数；本发明舍弃了传统的表型评估的低效方法，其通过全基因组重测序获取每一个育种群体样本的QTN基因型，同时结合农艺性状重要程度赋予其合理的权重值，建立水稻育种值评估系统，既能够合理评估育种值，又能够节约运算时间，提高水稻育种工作效率。
主权项：1.一种基于基因组分析的水稻种值评估方法，其特征在于：所述水稻种值评估方法包括以下步骤：步骤1，采集水稻品种的育种群体样本，分别进行全基因组重测序，测序深度覆盖基因组15倍以上；步骤2，将所述步骤1获得测序结果与水稻参考基因组进行比对，获得比对结果，采用RiceNavi软件的QTNpick模块对所述比对结果进行分析，获得每一个育种群体样本的QTN基因型；步骤3，根据RiceNavi软件中对等位基因功能的表述，将每一个育种群体样本的QTN基因型进行农艺性状归类，统计各农艺性状类别的QTN总数量并分别设置各农艺性状类别的权重值；步骤4，根据QTN的功能、农艺性状类别和每一个育种群体样本的QTN基因型，分别统计各农艺性状类别对应的纯合有利QTN基因型数量、纯合不利QTN基因型数量和杂合型QTN基因型数量；步骤5，计算每一个育种群体样本的育种值评估分数；其中，每一个农艺性状类别的育种值评估分数计算公式为：该农艺性状类别纯合有利QTN基因型数量-该农艺性状类别纯合不利QTN基因型数量*该农艺性状类别的权重值该农艺性状类别的总QTN数量*100+该农艺性状类别杂合型QTN基因型数量*2；每一个育种群体样本的育种值评估分数为各农艺性状类别的育种值评估分数之和。
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百度查询： 上海中科荃银分子育种技术有限公司 一种基于基因组分析的水稻种值评估方法及其水稻育种方法
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