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摘要：本发明公开了一种基于多层级病理图像融合的空间转录图谱生成方法，用于在缺少空间转录组分析设备的情况下依靠数字病理图像进行空间转录图谱的生成。本发明属于电子信息技术领域，技术方案要点包括：获取玻片标本在不同放大倍率下的感兴趣区域图像；将各层级感兴趣区域图像送入各自的卷积嵌入层中，得到各层级的序列化特征；对各层级的序列化特征进行单尺度的层级内特征提取，得到单尺度元素混合特征序列；对所有层级的单尺度元素混合特征序列进行跨尺度的层级间特征提取，得到跨尺度通道混合特征序列；将跨尺度通道混合特征序列的末尾元素送入线性回归器中，预测生成感兴趣区域的空间转录组基因计数；重复以上，获得整个玻片标本的空间转录图谱。
主权项：1.一种基于多层级病理图像融合的空间转录图谱生成方法，其特征在于，包括：S1：获取玻片标本在至少两个不同放大倍率下的全扫描病理图像；S2：分别在不同放大倍率下的全扫描病理图像的层级上进行病理图像的感兴趣区域采样，得到各层级图像；S3：将各层级图像分别送入各自的卷积嵌入层中，得到各层级的序列化特征，并在各层级的序列化特征末尾增加一个可学习的元素，用于编码整个序列的信息；S4：对各层级的序列化特征进行单尺度的层级内特征提取，得到单尺度元素混合特征序列；S5：将所有层级的单尺度元素混合特征序列拼接为一个完整的二维矩阵，对该二维矩阵进行跨尺度的层级间特征提取，得到跨尺度通道混合特征序列，再将所述跨尺度通道混合特征序列按照输入的分层重新拆分，重新得到若干个层级拆分后的跨尺度通道混合特征序列；S6：将若干个层级拆分后的跨尺度通道混合特征序列末尾的元素取出并拼接，得到一维向量，将该一维向量送入线性回归器中，得到感兴趣区域的空间转录组基因计数；S7：重复S2-S6，获得整个玻片标本的空间转录图谱。
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百度查询： 浙江大学 基于多层级病理图像融合的空间转录图谱生成方法
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