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循环游离DNA中肿瘤相关突变基因检测的参考品 

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申请/专利权人:杭州瑞普基因科技有限公司

摘要:本发明提供一种肿瘤相关突变基因检测技术的参考品,具体为一种用于血浆游离DNA突变检测的参考品。本发明还提供含有所述参考品的参考品盘,包含所述参考品或参考品盘的试剂盒,以及它们的用途。

主权项:1.一种参考品用于制备检测循环肿瘤DNA突变的试剂盒,其特征在于,所述参考品中包含:野生型DNA片段,和多种突变型DNA片段,每种所述突变型DNA片段具有多种碱基突变并且编码的氨基酸序列具有表1中列出的多种氨基酸突变;所述参考品中的突变型DNA片段编码的氨基酸序列包含如下a~i中的氨基酸突变,并且不含其他组的任何氨基酸突变:aEGFR的氨基酸突变p.E746_A750del,EGFR的氨基酸突变p.T790M,EGFR的氨基酸突变p.L858R,KRAS的氨基酸突变p.G12C;bEGFR的氨基酸突变p.G719A,EGFR的氨基酸突变p.E746_A750del,NRAS的氨基酸突变p.Q61K,KRAS的氨基酸突变p.G12V;cEGFR的氨基酸突变p.G719S,ALK的氨基酸突变EML4-ALK,BRAF的氨基酸突变p.V600E,KRAS的氨基酸突变p.G12D,PIK3CA的氨基酸突变p.H1047R;dEGFR的氨基酸突变p.L747_P753indelS,EGFR的氨基酸突变p.S768I,KRAS的氨基酸突变p.G13C,ERBB2的氨基酸突变p.A775_G776insYVMA;eEGFR的氨基酸突变p.C797S,KRAS的氨基酸突变p.G13D,PIK3CA的氨基酸突变p.E545K;fKRAS的氨基酸突变p.G12S,EGFR的氨基酸突变p.L747_A750delinsP,PIK3CA的氨基酸突变p.E542K;gALK的氨基酸突变EML4-ALK,KRAS的氨基酸突变p.G12A;hKRAS的氨基酸突变p.Q61H,EGFR的氨基酸突变p.L861Q,MET的氨基酸突变14exonskipping;iEGFR的氨基酸突变p.E746_S752delinsV,EGFR的氨基酸突变D770_N771insG,RET的氨基酸突变KIF5B-RET,ROS1的氨基酸突变CD74-ROS1,EGFR的氨基酸突变p.G719C;所述参考品中的突变型DNA片段包含如下a至i中的碱基突变,并且不含其他组的任何碱基突变:a对应所述p.E746_A750del的碱基突变c.2235_2249del15,对应所述p.T790M的碱基突变c.2369CT,对应所述p.L858R的碱基突变c.2573TG,对应所述p.G12C的碱基突变c.34GT;b对应所述p.G719A的碱基突变c.2156GC,对应所述p.E746_A750del的碱基突变c.2236_2250del15,对应所述p.Q61K的碱基突变c.181CA,对应所述p.G12V的碱基突变c.35GT;c对应所述p.G719S的碱基突变c.2155GA,对应所述EML4-ALK的亚型E6;A20,对应所述p.V600E的碱基突变c.1799TA,对应所述p.G12D的碱基突变c.35GA,对应所述p.H1047R的碱基突变c.3140AG;d对应所述p.L747_P753indelS的碱基突变c.2240_2257del18,对应所述p.S768I的碱基突变c.2303GT,对应所述p.G13C的碱基突变c.37GT,对应所述p.A775_G776insYVMA的碱基突变c.2324_2325ins12;e对应所述p.C797S的碱基突变c.2389TA,对应所述p.G13D的碱基突变c.38GA,对应所述p.E545K的碱基突变c.1633GA;f对应所述p.G12S的碱基突变c.34GA,对应所述p.L747_A750delinsP的碱基突变c.2239_2248delinsC,对应所述p.E542K的碱基突变c.1624GA;g对应所述EML4-ALK的亚型E13;A20,对应所述p.G12A的碱基突变c.35GC;h对应所述p.Q61H的碱基突变c.183AT,对应所述p.L861Q的碱基突变c.2582TA,对应所述14exonskipping的碱基突变c.3082+1GT;i对应所述p.E746_S752delinsV的碱基突变c.2237_2255delinsT,对应所述D770_N771insG的碱基突变c.2310_2311insGGT,对应所述KIF5B-RET的亚型K15;R12,对应所述CD74-ROS1的亚型C6;R34,对应所述p.G719C的碱基突变c.2155GT。

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