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申请/专利权人：生物梅里埃公司
摘要：一种以读数形式检测微生物的测序的基因组中预定位置处的靶基因组序列的方法。所述方法包括计算靶基因组序列邻域位置中基因组的局部测序深度，所述计算包括以下步骤：a在读数中检测来自所述微生物的至少一个参考基因组的一组数字基因组序列，b生成第三组数字基因组序列，其包含读数和属于邻域的第二组数字基因组序列，c计数第三组数字基因组序列中每个数字基因组序列的拷贝数，以及d计算局部测序深度等于计数的拷贝数的最大值。
主权项：1.用于检测微生物基因组中预定位置处的靶基因组序列的方法，包括：-制备包含所述微生物基因组至少一个拷贝的样本；-对所述样本进行测序以生成对应于所述微生物基因组的第一组数字基因组序列；-以及，对于每个靶基因组序列，计算机执行以下步骤：A.计算所述靶基因组序列的位置的领域中所述微生物基因组的局部测序深度；B.如果所述靶基因组序列的拷贝数高于计算的局部测序深度的预定分数，则检测所述靶基因组序列存在于所述微生物基因组中，其中计算局部测序深度的步骤包括以下步骤：A1.在第一组数字基因组序列中检测第二组数字基因组序列，所述第二组包括来自所述微生物的至少一个参考基因组的数字基因组序列；A2.生成第三组数字基因组序列，其包含：iii.属于所述靶基因组序列的位置的领域的第一组数字基因组序列；iv.属于所述靶基因组序列的位置的领域的第二组数字基因组序列；A3.计数第三组数字基因组序列中每个数字基因组序列的拷贝数；以及A4.计算所述局部测序深度等于计数的拷贝数的最大值。
全文数据：
权利要求：
百度查询： 生物梅里埃公司 通过全基因组测序检测微生物基因组中的基因组序列
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